Language
Country/Area
No result found
اختراق في أبحاث السرطان: كيف تغير طريقة DeMix فهمنا لنقاء الورم؟
مع التطور السريع لأبحاث السرطان، يبحث العلماء باستمرار عن أدوات وأساليب جديدة لفهم الخصائص البيولوجية للأورام بشكل عميق. تعتبر ولادة طريقة DeMix مظهرًا مهمًا لهذا الجهد. يمكن لهذا النهج الإحصائي تحليل نسخ السرطان المختلطة والتنبؤ بدقة بنسبة عينات الورم والخلايا اللحمية، وبالتالي تعميق فهمنا لنقاء الورم.
"إن عدم التجانس العالي لعينات الورم لا يؤدي إلى تعقيد تحليل البيانات الجينومية السرطانية فحسب، بل قد يؤدي أيضًا إلى التحيز."
وفقًا لبحث أجراه آهن وآخرون، تأخذ طريقة DeMix بشكل أساسي في الاعتبار أربعة مواقف محتملة، سواء كانت ورمًا مطابقًا وعينات طبيعية أو عينات غير متطابقة، ويمكنها التنبؤ بشكل فعال بنسبة الخلايا السرطانية في العينات المختلطة. يعد هذا العمل ذا أهمية كبيرة لأنه داخل عينات الورم غالبًا ما توجد مجموعات نسيلية متعددة من الخلايا السرطانية جنبًا إلى جنب مع الأنسجة الطبيعية المجاورة والسدى والخلايا المناعية المتسللة.
من أجل القضاء على هذا التباين بشكل فعال، وجد باحثو السرطان أخيرًا أداة DeMix الجديدة. تستخدم هذه الطريقة أولاً نموذجًا خطيًا مختلطًا لحساب النسبة النسبية للخلايا السرطانية والخلايا الطبيعية في العينة الإجمالية. من الناحية العملية، يؤكد عدم التجانس العالي لعينات الورم على أهمية تقدير نقاء الورم عند إجراء تحليل البيانات. يشير النقاء إلى النسبة المئوية للخلايا السرطانية في عينة الورم، ودقة هذه المعلمة أمر بالغ الأهمية لنتائج التحليل اللاحقة.
"توضح طريقة DeMix أنه عند التحليل من بيانات المصفوفة الدقيقة، يكون استخدام البيانات الأولية كمدخل للتنبؤات أكثر أهمية من استخدام البيانات المعالجة."
يعمل DeMix على افتراض أن العينة المختلطة تتكون من نوعين فقط من الخلايا، الخلايا السرطانية والخلايا الطبيعية. بالنسبة للخلايا الطبيعية، يستخدم الباحثون بيانات خارجية لتقدير ملفات تعريف التعبير للجينات المرجعية بدقة. وهذا يعني أنه حتى لو لم تتم ملاحظة التعبير الجيني المحدد للخلايا السرطانية في عينة الورم، فيمكن استنتاجه بشكل فعال من بيانات الخلايا الطبيعية.
فيما يتعلق بتطبيقات محددة، تحتاج طريقة DeMix إلى تلبية شروط معينة، خاصة عند معالجة البيانات الجينومية عالية الإنتاجية. تبدأ العملية بالتنبؤ بنسب الورم من خلال مبدأ تقدير الاحتمالية القصوى، يليه استنتاج تفصيلي للجينات الفردية. يوفر وضع التشغيل ذو المرحلتين الخاص بـ DeMix إمكانيات جديدة لتحليل نقاء الورم التاريخي.
"سيؤدي اقتراح هذه الطريقة الجديدة إلى تحسين نموذج البيانات لتحليل تكوين الخلايا في الأورام ووضع الأساس للممارسة السريرية والعلاج الشخصي."
من الجدير بالذكر أن قابلية التطبيق الشامل لطريقة DeMix تستفيد من إمكانياتها المرنة في معالجة البيانات. فهو لا يأخذ في الاعتبار حالة الجينات المرجعية المختلفة فحسب، بل يمكنه أيضًا التكيف مع تصميمات العينات المختلفة. على الرغم من أن الخوارزمية تتطلب جينًا مرجعيًا واحدًا على الأقل، فمن المستحسن استخدام ما يصل إلى خمسة إلى عشرة جينات لتقليل تأثير القيم المتطرفة، مما يمكّن الباحثين أيضًا من الحصول على نتائج استدلالية أكثر دقة.
من خلال التمييز الدقيق بين الخلايا السرطانية والخلايا الطبيعية، لا يعمل DeMix على تحسين دقة تقدير نقاء الورم فحسب، بل يخلق أيضًا اتجاهًا جديدًا لأبحاث جينومات الأورام المستقبلية. ويظهر إمكانات كبيرة، سواء في التنبؤ باستجابة الورم للعلاج أو في مراقبة تطور السرطان.
"إن تطوير DeMix يجعلنا نفهم مرة أخرى مدى أهمية تحليل البيانات المجردة في أبحاث السرطان."
في المستقبل، وبمساعدة طريقة DeMix، قد يتمكن العلماء من تحليل عدم تجانس الأورام بشكل أكثر عمقًا وتوفير خيارات علاج أكثر تخصيصًا. هل يعني هذا أنه سيكون هناك تحول جوهري في كيفية فهمنا وعلاجنا للسرطان؟
