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Wie können Sie die Genauigkeit von MNGs während des Stichprobenprozesses sicherstellen? Kennen Sie diese Tipps?
Mit der raschen Entwicklung der Technologie ist die klinische Metagenom-Sequenzierung der nächsten Generation (MNGS) zu einem leistungsstarken Werkzeug zur Diagnose von Infektionskrankheiten geworden. Diese Technik ermöglicht eine umfassende Analyse von genetischem Material aus Mikroorganismen und Wirten aus klinischen Proben, ohne einen bestimmten Erreger zu kennen. Die Gewährleistung der Genauigkeit dieser Technologie während des Probenahmeprozesses bleibt jedoch eine wichtige Herausforderung.
Die herkömmlichen Erfassungsmethoden werden häufig durch Probenverarbeitung und Hintergrundgeräusche gestört, und MNGs können gleichzeitig mehrere Krankheitserreger erkennen, was ihr größter Vorteil ist.
korrekte Ausführung von Stichproben
Die Genauigkeit von MNGs hängt zunächst von der korrekten Probensammlung ab. Im Allgemeinen sind Blut-, Cerebrospinalflüssigkeits-, Urin- und Nasopharyngealströme die am häufigsten verwendeten Proben. Diese Proben müssen mit Vorsicht gesammelt werden, insbesondere wenn traumatische Eingriffe wie Lendenpunktionen durchführen, muss die Kreuzkontamination vermieden werden. Die Sauberkeit der Probe beeinflusst direkt die Genauigkeit der nachfolgenden Sequenzierung, sodass die Probenahme in einer sterilen Umgebung durchgeführt werden muss.
Vorsichtsmaßnahme bei der Nukleinsäurextraktion
Während des Extraktionsprozesses ist es auch wichtig, das richtige Extraktionskit zu wählen. Beispielsweise kann die Auswahl einer spezifischen RNA- oder DNA -Extraktionsmethode für Proben mit hohem Umgebungsgeräuschen die Spezifität und Bequemlichkeit des Erregers nach dem Erreger verbessern. Der Extraktionsprozess erfordert sicher, dass die Pathogen -RNA/DNA in der Probe effektiv extrahiert werden kann und der Einfluss von Hintergrundrauschen minimiert werden sollte.
Mit zielgerichteten Anreicherungsmethoden wie negativer Selektion oder positiver Anreicherung können die Nachweisrate von Pathogensignalen in der Probe verbessert werden.
Auswählen der Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologie
Während der Sequenzierungsphase ist die Auswahl der rechten Sequenzierungsplattform auch für die Genauigkeit der Ergebnisse von entscheidender Bedeutung. Im Allgemeinen ist das Illumina -MiSeq -System die bevorzugte Plattform für weit verbreitete Forschung in der Infektionskrankheiten und läuft schnell und bietet eine starke Unterstützung in der Gemeinschaft. Mit der Verbesserung der Technologie werden andere Plattformen wie Minion nach und nach potenzielle Optionen, insbesondere für kleine Labors mit begrenzten Ressourcen.
Die Bedeutung der Bioinformatikanalyse
Die Sequenzierungsdatenanalyse erfordert auch professionelles Bioinformatikwissen, das Datenreinigung, Scherung und Deduplizierung umfasst, um die Genauigkeit der Ergebnisse zu verbessern. Das Entfernen von Lesevorgängen aus dem Host -Genom, um das Hintergrundrauschen zu verringern, ist ein kritischer Schritt in diesem Prozess. Darüber hinaus müssen die Analyseergebnisse mit der öffentlichen Datenbank verglichen werden, um den organisatorischen Umfang zu identifizieren, der die Zuverlässigkeit der nachfolgenden Ergebnisse gewährleistet.
Strategien zur Bewältigung von Herausforderungen
Derzeit ist die Umsetzung von MNGs mit vielen klinischen Herausforderungen, wie z. B. klinische Praktikabilität, Laborwirksamkeit und Kosten. Daher ist die kontinuierliche Verbesserung dieser Prozesse und Technologien ein wichtiger Bestandteil der Genauigkeit der MNGS -Erkennung. Eine gezielte Überwachung und die Einrichtung von Referenzstandards können ihre wirksame Anwendung im medizinischen Bereich fördern.
Kombination herkömmlicher mikrobieller Tests und MNGS -Technologie kann die Diagnoseempfindlichkeit und Genauigkeit verbessern, insbesondere bei der Überwachung komplexer Infektionen.
Voraussicht Reflexion
Die zukünftige Entwicklung von MNGs hängt nicht nur vom technologischen Fortschritt ab, sondern erfordert auch eine umfassende Akzeptanz und klinische Überprüfung der medizinischen Gemeinschaft. Wenn sich der Anwendungsbereich erweitert, zeigen mehr Fälle ihren Wert bei der Diagnose von Infektionskrankheiten. Sind wir bereit für die revolutionären Änderungen, die durch diese Technologie verursacht werden?
