In biologischen Systemen sind Enzyme wichtige Moleküle, die chemische Reaktionen ermöglichen. Obwohl wir uns normalerweise auf Proteinenzyme und RNasen konzentrieren, sind Desoxyribozyme in den letzten Jahren nach und nach aufgetaucht und zu einem heißen Thema in der wissenschaftlichen Forschung geworden.
Desoxyribase, auch DNase genannt, ist ein DNA-Oligonukleotid, das spezifische chemische Reaktionen durchführen kann. Mittlerweile ist die Rolle von RNasen und Proteinasen als Biokatalysatoren seit langem bekannt. Forschungen zu Desoxyribase haben die wesentlichen Unterschiede in den katalytischen Aktivitäten von DNA und RNA offenbart, was uns ein tieferes Verständnis dieser beiden Nukleinsäuren ermöglicht hat.
Die chemische Aktivität von Desoxyribase ist in vielen Fällen schwächer als die von RNase und Proteinase.
Die Seltenheit der Desoxyribase hängt eng mit ihrer chemischen Struktur zusammen. DNA besteht aus vier chemisch ähnlichen Basen, wodurch sie bei katalytischen Reaktionen nur eine begrenzte Anzahl von Wechselwirkungen wie Wasserstoffbrückenbindungen, π-Stapelung und Metallionenkoordination durchführen kann. Im Gegensatz dazu bestehen Proteine aus bis zu zwanzig verschiedenen Aminosäuren, was ihnen größere katalytische Eigenschaften und Vielfalt verleiht. Darüber hinaus liegt die Struktur der DNA meist in Form einer Doppelhelix vor, was ihre physikalische Flexibilität und Fähigkeit zur Bildung dreidimensionaler Strukturen einschränken würde.
Seit 1994 haben Wissenschaftler damit begonnen, Desoxyribozyme mit katalytischer Aktivität zu erforschen und zu synthetisieren. Am Beispiel von GR-5 kann es die Spaltung von Phosphatbindungen katalysieren und weist dabei eine katalytische Effizienz auf, die 100-mal höher ist als die unkatalysierter Reaktionen. Seitdem hat die wissenschaftliche Gemeinschaft mehrere andere Desoxyribozyme entdeckt, die mit Metall-Coenzymen synergetisch wirken können, darunter die Mg2+-abhängige E2-Desoxyribase und die Ca2+-abhängige Mg5-Desoxyribase.
Um die Funktionen von Desoxyribozymen besser zu verstehen, müssen wir zunächst verstehen, dass sie sich in ihrer Struktur und ihrem katalytischen Mechanismus erheblich von RNasen und Proteinenzymen unterscheiden.
Darüber hinaus zeigt die Selektivität der Desoxyribase auch eine besondere chemische Selektivität. Spezifische Desoxyribozyme haben eine hohe Affinität zu bestimmten Metall-Coenzymen wie Pb2+ oder Natriumionen, was besonders bei der Durchführung von RNA-Pfropfreaktionen deutlich wird. Diese Art der Desoxyribase-basierten katalytischen Reaktion und ihr Potenzial zur Virusunterdrückung, Tumorbehandlung und anderen Anwendungen machen sie zu einer der potenziellen Therapien.
Der Anwendungsbereich von Desoxyribase ist recht breit. Die Erforschung von Behandlungsmöglichkeiten für Asthma, Colitis ulcerosa und bestimmte Krebsarten schreitet in klinischen Studien voran. Untersuchungen zeigen, dass SB010, eine speziell entwickelte Desoxyribase, den Transkriptionsfaktor GATA-3 eines bestimmten Signalwegs wirksam hemmen kann, was in Studien, die unter Anleitung von Krankenpflegern durchgeführt wurden, eine gute Wirksamkeit und Sicherheit zeigte.
Der Einsatz von Desoxyribozymen zur Transkription und zum Targeting spezifischer mRNA könnte der Schlüssel zur zukünftigen Biomedizin sein.
Darüber hinaus zeigen Desoxyribozyme auch Potenzial in Bereichen wie der Umweltdetektion und der biologischen Bildgebung. Beispielsweise wurde Desoxyribase in der Vergangenheit zum Nachweis von Bleiionen in Wasser verwendet, was sein Potenzial als Metallbiosensor bewies.
Im Vergleich zu RNase sind die Vorteile von Desoxyribase Kosteneffizienz, Synthesegenauigkeit und Sequenzlänge. Die Entwicklung von RNase begann in den 1980er Jahren, aber die Entwicklung von DNase und ihre Flexibilität in der chemischen Synthese haben ihre Einzigartigkeit bewiesen. Wenn beispielsweise einige DNA-Katalysatoren einer asymmetrischen Synthese unterzogen werden, kann eine Änderung ihrer Struktur je nach Reaktionsbedingungen ihre katalytische Wirkung effektiv verbessern.
Obwohl es sich bei den aktuellen Mainstream-Katalysatoren hauptsächlich um Protein- und RNA-Stretcher handelt, hat uns die Geburt der Desoxyribase dazu gebracht, das katalytische Potenzial von Nukleinsäuren zu überdenken und zu überlegen, wie sich dieses Potenzial auf die zukünftige Biomedizin und synthetische Chemie auswirken wird.
Wir sollten wahrscheinlich darüber nachdenken, wie die Untersuchung von Desoxyribozymen unser Verständnis von Biokatalyse und Nukleinsäuren verändern wird.