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Les secrets des microbes : Comment identifier des bactéries mystérieuses par leur morphologie de colonisation ?
En microbiologie, la morphologie coloniale fait référence à l'apparence visuelle des bactéries ou des champignons cultivés sur un milieu de culture. L’examen de la morphologie de la colonisation est la première étape dans l’identification des micro-organismes inconnus. En évaluant systématiquement l’apparence de la colonisation, les microbiologistes sont en mesure de sélectionner le test approprié pour déterminer l’identité spécifique du micro-organisme en fonction de caractéristiques telles que la taille, la forme, la couleur, la transparence et la consistance qui fournissent des indices sur son identité.
Procédures de test microbiologique
Lorsqu'un échantillon arrive au laboratoire de microbiologie, il est d'abord inoculé dans un milieu gélosé et placé dans un incubateur pour favoriser la croissance des micro-organismes. Étant donné que l’apparence de la colonisation microbienne change à mesure qu’elle se développe, la morphologie de la colonisation doit être examinée à des moments précis après l’inoculation. Les mesures sont généralement prises 18 à 24 heures après l'inoculation, bien que cela puisse être différent pour les organismes à croissance plus lente tels que les champignons.
Les microbiologistes observent attentivement l’apparence des colonies, en notant des caractéristiques spécifiques telles que la taille, la couleur, la forme, la consistance et la transparence.
La transparence peut être décrite comme transparente, translucide ou opaque. En général, les staphylocoques sont opaques, tandis que de nombreux streptocoques sont souvent translucides. La forme générale des colonies peut être caractérisée comme circulaire, irrégulière ou petite (comme des points d'épingle). Une autre caractéristique d'identification est la croissance verticale ou la protubérance de la colonie, qui peut être évaluée en inclinant le milieu gélosé sur le côté et en l'évaluant comme étant plat, surélevé, convexe, arrondi (très convexe), concave (avec une dépression au centre) , ou cela peut être exprimé au moyen d'une crête (un renflement au centre), etc.
Les caractéristiques de la marge coloniale peuvent être décrites à l’aide de termes tels que lisse, rugueux, irrégulier et filigrane.
Conformité et indicateurs spéciaux
Vérifiez la consistance de la colonie en la touchant physiquement avec un outil stérile. On peut le décrire à l’aide de mini phrases comme croquant, crémeux, collant et sec. Les staphylocoques ont généralement une texture crémeuse, tandis que certaines espèces de Neisseria sont plus visqueuses, et la colonisation par la diphtérie et les streptocoques bêta-hémolytiques est généralement sèche. Les bactéries qui produisent des capsules ont souvent une consistance glissante (semblable à de la boue).
Lorsque certains micro-organismes sont cultivés sur de la gélose au sang, ils peuvent digérer le sang présent dans le milieu, ce qui entraîne une hémolyse notable sur la plaque de gélose. Dans le contexte de la morphologie de la colonisation, l’hémolyse est divisée en trois types : l’hémolyse alpha, l’hémolyse bêta et l’hémolyse gamma. L'hémolyse alpha se produit lorsque le sang est partiellement digéré, ce qui entraîne une décoloration verte autour des colonies, tandis que l'hémolyse bêta se produit lorsque l'organisme digère complètement le sang, laissant une zone claire autour de chaque colonie. Les organismes qui ne produisent pas d'hémolyse sont appelés hémolyse gamma.
Par exemple, Clostridium difficile, la bactérie responsable de la gangrène gazeuse, est connue pour produire une hémolyse complète et incomplète « à deux zones ».
Odeur et autres caractéristiques
Les odeurs culturelles sont parfois considérées comme faisant partie des formations coloniales. Bien qu'il ne soit pas recommandé de renifler intentionnellement les cultures microbiennes, certains micro-organismes produisent des odeurs uniques, comme Pseudomonas aeruginosa, qui dégage un arôme de raisin, Staphylococcus aureus, qui sent les vieilles chaussettes, et Proteus, qui sent alternativement comme Décrit comme rance ou comme un gâteau au chocolat.
D’autres caractéristiques uniques de la forme coloniale comprennent la motilité et la production de pigments. Pseudomonas aeruginosa produit de la cyanine et de la xanthophycétine, qui donnent aux colonies un éclat vert, tandis que certaines chromobactéries produisent un pigment rouge orangé appelé ploïdycine.
Explication et application
La morphologie coloniale est la première étape de l’identification des espèces microbiennes à partir d’échantillons cliniques. En fonction de l’aspect visuel de la colonisation, les microbiologistes peuvent affiner la liste des organismes possibles et ainsi sélectionner le test approprié pour fournir un diagnostic définitif. L'observation de l'hémolyse est très utile pour identifier certaines bactéries comme les streptocoques, qui sont classées en fonction de leur réaction hémolytique.
Bien que les techniques automatisées telles que MALDI-TOF soient de plus en plus utilisées dans les laboratoires cliniques pour identifier les micro-organismes, la morphologie de la colonisation permet toujours de distinguer les agents pathogènes potentiels de la flore normale, car l'identification de la flore normale n'est généralement pas nécessaire. identification, et lorsque les techniques automatisées donnent des résultats ambigus, l'évaluation de la morphologie coloniale peut confirmer davantage l’identité.Par exemple, Streptococcus pyogenes, responsable des maux de gorge et de la scarlatine, présente une hémolyse bêta, tandis que Streptococcus pneumoniae présente une hémolyse alpha.
Cette série d'observations et de comparaisons nous permet non seulement d'acquérir une compréhension plus approfondie de la diversité des micro-organismes, mais aussi d'ouvrir davantage la réflexion. Quels rôles jouent ces micro-organismes dans l'environnement dans lequel nous vivons ?
