Depuis la découverte du VIH (virus de l'immunodéficience humaine) en 1983, le génome et la structure protéique de ce virus font l'objet de recherches scientifiques. Initialement, on pensait qu'il était lié au virus de la leucémie humaine à cellules T (HTLV), mais au cours de recherches menées à l'Institut Pasteur en France, des scientifiques ont isolé ce nouveau rétrovirus génétiquement différent de patients atteints du SIDA et l'ont ensuite identifié comme étant le VIH.
Chaque virion du VIH est constitué d'une enveloppe virale et de structures matricielles associées, entourées d'une coquille contenant deux génomes d'ARN simple brin et plusieurs enzymes.
Le VIH est structurellement différent des autres rétrovirus. La particule du virus VIH mesure environ 100 nanomètres de diamètre et sa région interne comprend un noyau concave qui contient non seulement deux copies (+ brin) du génome de l'ARN simple brin, mais également des enzymes importantes telles que la transcriptase inverse, l'intégrase et la protéase. . Le génome de l'ARN du VIH est codé par huit protéines virales essentielles au cycle de vie du VIH.
Le génome du VIH contient 9 gènes, qui codent pour 15 protéines virales et sont synthétisés sous forme de polypeptides. Ces polypeptides peuvent produire des protéines structurelles au sein du virus, des enzymes virales ou des glycoprotéines de l'enveloppe virale.
Le VIH utilise un système complexe d'épissage différentiel d'ARN pour obtenir neuf produits génétiques différents à partir d'un génome de moins de 10 kb.
Les fonctions de ces gènes incluent la production de protéines structurelles ainsi que la régulation et l'assistance à la synthèse des protéines. En particulier, le gène gag fournit la structure physique de base du virus, tandis que le gène pol est à la base du mécanisme de régénération des rétrovirus.
Certaines protéines clés du VIH comprennent :
gag
: code pour le polypeptide gag précurseur, qui est transformé en protéines structurelles par la protéase virale pendant la maturation du virus. pol
: responsable du codage de la transcriptase inverse et de l'intégrase. Ces enzymes sont essentielles au cycle de vie du virus. env
: code pour une glycoprotéine d'enveloppe, qui est principalement responsable de la liaison au récepteur CD4 de la cellule hôte et de la promotion du virus pour pénétrer dans la cellule. Parmi eux, gp120 et gp41 codés par env
sont les glycoprotéines les plus importantes dans le processus d'infection par le VIH et sont les principales cibles du développement de vaccins.
La structure de la protéine Env est très particulière, avec une concentration élevée de glycosylation de la chaîne N, qui peut bloquer efficacement la neutralisation du VIH par les anticorps.
Cette structure hautement glycosylée fait du VIH un agent pathogène extrêmement complexe, et les scientifiques ont travaillé dur pour trouver un vaccin capable de surmonter cette protection.
Le VIH possède également diverses protéines régulatrices, telles que tat et rev, etc. Ces protéines jouent un rôle important dans l'expression des gènes du VIH et la réplication virale. La présence de ces protéines peut réguler le cycle de vie du VIH dans les cellules hôtes. Les protéines auxiliaires telles que Vpr, Vif et Nef affectent le pouvoir infectieux du virus et la réponse de la cellule hôte.
La structure de l'ARN du VIH comprend non seulement la région non traduite terminale 5' (UTR), mais contient également certaines structures secondaires conservées, qui peuvent réguler le processus de transcription inverse virale. Y compris la région d'activation de la transcription (TAR), la structure d'empaquetage virale, etc., ces structures secondaires sont considérées comme ayant un impact important sur le cycle de vie du VIH.
La boucle V3 fait partie de la glycoprotéine gp120 de l'enveloppe du virus VIH, qui permet au virus d'infecter avec succès les cellules immunitaires humaines. Cette structure permet non seulement au virus de pénétrer dans les cellules hôtes, mais devient également une cible clé pour le développement de traitements et de vaccins.
Avec l'approfondissement de la recherche, les scientifiques ont progressivement résolu le mystère de la structure et de la fonction du VIH. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés, de nombreux problèmes restent encore à résoudre. Par exemple, quel genre de percées un virus aussi intelligemment conçu peut-il apporter dans le développement futur de vaccins ?