Pada populasi liar berbagai hewan, tumbuhan, dan jamur, selain kariotipe normal, terdapat pula kromosom B (juga dikenal sebagai superkromosom). Kromosom ini tidak penting bagi kehidupan spesies dan sama sekali tidak ada pada beberapa individu. Oleh karena itu, populasi tertentu mungkin mengandung jumlah kromosom B yang berbeda, yang menunjukkan variasi seperti 0, 1, 2, 3, dst. Kromosom B ini berbeda dari kromosom penanda atau salinan tambahan kromosom normal, dan pembentukan serta evolusinya masih menjadi misteri.
"Kromosom supernumerari dapat dianggap sebagai kategori khusus polimorfisme genetik. Karena berbagai mekanisme akumulasi, kromosom ini tidak mengikuti hukum pewarisan Mendel biasa."
Asal usul evolusi jenis kromosom ini masih belum jelas, tetapi diperkirakan bahwa kromosom ini mungkin berasal dari bagian heterokromatik kromosom normal. Mengambil contoh pengurutan gen generasi berikutnya, telah ditemukan bahwa kromosom B pada gandum hitam sebenarnya merupakan fusi dari kromosom gandum hitam A. Kromosom B pada beberapa ikan cichlid Afrika (Haplochromis latifasciatus) juga telah dipastikan berasal dari rekombinasi kromosom A normal.
Meskipun sebagian besar kromosom B pada dasarnya heterokromatik, yaitu, mereka memiliki fungsi pengkodean yang terbatas, beberapa mengandung segmen euchromosomal yang cukup besar, seperti kromosom B pada jagung. Selain itu, terdapat keragaman dalam fungsi kromosom B. Dalam beberapa kasus, mereka dapat bertindak sebagai elemen genetik yang egois, tetapi mereka juga dapat memberikan keuntungan positif dalam beradaptasi dengan lingkungan. Misalnya, belalang Inggris (Myrmeleotettix maculatus) memiliki dua jenis kromosom B struktural. Ketika mereka muncul di lingkungan tropis yang kering, jumlahnya meningkat secara signifikan, tetapi mereka relatif jarang di lingkungan yang basah dan dingin. Ini juga menggambarkan korelasi antara kromosom supernumerary dan habitat tertentu.
"Saat ini diketahui bahwa kromosom supernumerary akan memiliki efek buruk selama reproduksi serbuk sari, tetapi efek menguntungkan juga umum terjadi di lingkungan tertentu."
Di dunia jamur, keragaman kromosom tersebar luas. Bahkan isolat yang berbeda dari spesies yang sama sering kali memiliki jumlah kromosom yang berbeda, dan kromosom ekstra ini tidak diperlukan untuk pertumbuhan normal dalam kultur. Oleh karena itu, kromosom supernumerary disebut kromosom yang dapat dibuang secara bersyarat karena dapat memberikan keuntungan selektif dalam lingkungan tertentu. Meskipun kromosom supernumerary ini tidak membawa gen yang diperlukan untuk pertumbuhan dasar, kromosom ini mungkin memiliki beberapa signifikansi fungsional.
“Misalnya, kromosom supernumerari dari patogen kacang polong Haematonectria haematococca membawa gen yang penting untuk patogenisitasnya.”
DNA dalam kromosom supernumerari ini ditemukan mengkodekan sekelompok enzim yang memetabolisme racun yang disekresikan oleh sistem kekebalan tanaman. Untuk patogen jamur Zymoseptoria tritici yang menyerang gandum, ia memiliki sebanyak delapan kromosom suplai, jumlah kromosom supernumerari tertinggi yang pernah diamati pada jamur.
Dalam kerajaan tumbuhan, kromosom B merupakan cerminan penting dari keanekaragaman genetik, dan kromosom supernumerari ini umumnya diamati pada spesies tanaman berbunga yang diserbuki secara alami. Kromosom B muncul dalam berbagai bentuk pada spesies yang berbeda, dan jumlahnya bervariasi di antara anggota kelompok tanaman yang sama. Misalnya, spesies saudara Aegilops speltoides dan Aegilops mutica memiliki salinan kromosom B di jaringan udaranya tetapi tidak memiliki kromosom tambahan ini di akarnya. Kromosom B pada tumbuhan sangat berbeda dari kromosom normal dalam hal struktur dan ukuran morfologi, dan biasanya "nonhomolog dan lebih kecil dari kromosom A terkecil".
Dengan semakin mendalamnya penelitian, para ilmuwan semakin memperdalam pemahaman mereka tentang mekanisme pembentukan dan proses evolusi kromosom B, tetapi apa peran mereka dalam dunia biologi?