SOS 応答は、細胞が DNA 損傷に直面したときの全体的な応答メカニズムです。このプロセスの間、細胞周期は一時停止し、DNA 修復と遺伝子変異のプロセスが開始されます。この現象の核心は RecA タンパク質にあります。一本鎖 DNA が出現すると、RecA タンパク質が刺激され、一連の生化学反応が始まり、SOS 応答が開始されます。
「RecA タンパク質の役割は DNA を修復することだけではなく、細胞がストレスに反応する方法に関する新しい視点を提供することです。」
SOS 応答の概念は、Evelyn Witkin によって最初に提案されました。ウィトキン氏とポスドク研究員のミロスラフ・ラドマン氏は、変異した大腸菌の表現型特性を研究することで、細菌の紫外線に対するSOS反応を詳細に解明した。このシステムの発見は、細胞が DNA 損傷に対する反応を調整できることを証明するだけでなく、細胞のストレス反応に関する詳細な研究への道を開きます。
通常の成長条件下では、SOS 遺伝子は LexA 阻害タンパク質二量体によって負に制御されます。 LexA は、特定の 20 bp コンセンサス配列 (SOS ボックス) に結合することで、これらの遺伝子の発現を抑制します。しかし、DNA が損傷すると、複製フォークに一本鎖 DNA 領域が蓄積し、RecA タンパク質は ATP 依存的にこれらの一本鎖 DNA 領域の周囲に糸状の構造を形成し始め、活性化されます。
「RecA タンパク質が活性化されると、LexA 阻害タンパク質が自己切断され、SOS 遺伝子の阻害が解除されます。」
LexAの濃度が減少すると、対応するSOS遺伝子が発現し始めます。このプロセスは段階的かつ秩序立ったものです。LexA は特定のオペレーター (lexA、recA、uvrA など) に対する親和性が弱いため、これらの遺伝子は SOS 応答で最初に完全に活性化され、修復プロセス中に優先的に発現されます。
この研究では、SOS応答システムが突然変異を引き起こし、さらに抗生物質耐性を引き起こす可能性があることが判明しました。 SOS 応答中、世界中の 3 つの低忠実度 DNA ポリメラーゼ (Pol II、Pol IV、Pol V) が突然変異率を高めます。そのため、多くの研究チームが現在、SOS修復を阻止できる薬の開発を目指してこれらのタンパク質をターゲットにしています。
「病原体が抗生物質耐性を発達させるまでの時間を延ばすことで、一部の抗生物質の長期的な有効性が向上する可能性がある。」
大腸菌では、さまざまな種類の DNA 損傷因子が SOS 応答を開始する可能性があります。 lac オペレーターを SOS 関連タンパク質によって制御されるオペレーターに融合することで、遺伝毒性を検出するための簡単な比色アッセイを実装できます。ラクトース類似体を加えると、ベータガラクトシダーゼによって分解され、分光光度計で定量的に測定できる色のついた化合物が生成されます。色の変化の度合いは、DNA 損傷の度合いを間接的に測定するものです。
シアノバクテリアは酸素を発生する光合成が可能な唯一の原核生物であり、地球の酸素大気に大きな影響を与えてきました。プロクロロコッカスやシネココッカスなどの一部の海洋シアノバクテリアでは、大腸菌のSOSシステムと類似したSOSシステムを持っていることが分かっており、大腸菌のSOS遺伝子と相同な遺伝子( lexA および sulA)。
RecA タンパク質と SOS 応答メカニズムの詳細な研究により、科学者は将来病原体が耐性を発達させるのを防ぐための新しい戦略を見つけることができるでしょうか?