遺伝子技術の進歩に伴い、DNA 損傷の研究はますます重要になっています。この分野では、シングルセルゲル電気泳動検査(コメットアッセイとも呼ばれる)と呼ばれる技術が徐々に注目を集めています。これは、個々の真核細胞のレベルで DNA 損傷を検出できるシンプルで高感度な技術です。この技術は 1984 年に Östling と Johansson によって初めて開発され、1988 年に Singh らによって改良されました。現在まで、DNA 損傷/修復の評価および遺伝毒性試験の標準的な手法の 1 つとなっています。
コメット アッセイの名前は、電気泳動ゲル内の DNA の移動パターンに由来しており、しばしば彗星に似ています。
コメットアッセイの基本的な手順には、細胞を低融点アガロースに包埋し、中性またはアルカリ性条件下で細胞を溶解し、電気泳動を実行することが含まれます。電気泳動後、損傷した DNA はさまざまな形になり、彗星の尾部と頭部の間の相対強度が DNA 損傷の程度を反映します。この技術の基礎は、損傷を受けていない DNA は細胞核内のマトリックスタンパク質と関連して高度に組織化されており、DNA が損傷するとこの組織化が破壊され、損傷を受けていない DNA 構造が解放されるということです。
まず、インビトロの細胞培養物またはインビボの被験者から得た細胞サンプルを個々の細胞に分散させ、37℃の低融点アガロースに懸濁します。次に、この単一の懸濁液を顕微鏡スライドに適用し、カバーガラスを下げると、アガロースが膨張して薄い層を形成します。アガロースを 4°C で凍結すると、細胞がその中に固定され、細胞の位置を安定させるアガロースマトリックスが形成されます。
次に、スライドを溶解溶液に浸します。溶解溶液には通常、高濃度の水溶性塩と界面活性剤が含まれています。これらの成分は細胞内のタンパク質を破壊し、細胞膜を引き裂き、DNA を損傷しないようにします。残りの DNA 構造は核種と呼ばれ、比較的大きく規則的な構造を形成します。
溶解プロセス後、スライドを洗浄してすべての塩を除去し、電気泳動溶液に浸します。このとき、特定の電場が印加され、損傷したDNAは鎖部分の長さに応じて電場に引き寄せられ、最終的に彗星のような尾部と頭部の構造を形成します。
画像解析技術により、核種の全体的な蛍光強度と移動する DNA の蛍光が定量化され、DNA 損傷の程度を評価できるようになります。
コメットテストには、遺伝毒性試験、人間の生体モニタリング、分子疫学、生態学的遺伝毒性学など、幅広い用途があります。これは、科学者がさまざまな環境要因が DNA に及ぼす影響を理解するのに役立つだけでなく、老化中の DNA 損傷を追跡することで老化プロセスについての理解を深めることもできます。
たとえば、Swain と Rao は、コメット アッセイにより、老齢ラットの脳ニューロンとアストロ サイトの DNA 損傷が大幅に増加したことを研究で報告しました。
さらに、コメット検査は男性不妊の診断にも重要な応用価値があります。この検査技術は、精子の DNA 断片化の程度を評価し、体外受精中に起こり得る結果を予測するのに役立ちます。
コメットアッセイは DNA 損傷を検出するための非常に高感度な方法ですが、その感度により、結果の再現性に影響を与える可能性のある物理的変化に対して特に敏感になります。したがって、この手順を実行するときは、DNA 損傷を引き起こす可能性のある干渉因子を避けるために特別な注意を払う必要があります。
コメットテストは、シンプルで費用対効果の高い技術として、複雑な条件と限られた資金のある研究環境でよく使用されます。より多くの研究と改良されたツールの出現により、この技術の応用の見通しは有望であり、将来的にはより多くの科学的ボトルネックを突破し、DNA修復の新しい方法を発見できるでしょうか?