生化学の世界では、タンパク質合成は生命の中核機能の 1 つです。しかし、このプロセスに伴うエラー率は科学者たちを驚かせました。研究によると、タンパク質合成におけるエラー率は10のマイナス4乗に相当し、リボソームがtRNAのアンチコドンとmRNAのコドンをペアにすると、これらの相補配列をほぼ常に正しく一致させることができることを意味する。 。では、生命の構成要素をこれほど精密に作るメカニズムとは何でしょうか?
ホップフィールドは、酵素が正しい反応経路と間違った反応経路を区別し、予想よりも高い精度で合成を完了できるようにするプロセスである「速度論的補正」の概念を初めて提唱しました。
このエラー率の背後では、動的補正とエネルギー散逸が重要な役割を果たしています。簡単に言えば、酵素が反応の誤りを検出すると、反応物を不可逆な状態にすることができ、誤った反応物が合成経路から早期に抜け出しやすくなります。このプロセスの中心にあるのは、精度とエネルギー消費の密接な関係です。
例えば、このプロセスを医薬品製造ラインと比較すると、出口での風力を増加させると、この方法によって全体のコストが削減されたとしても、空の箱がラインから吹き飛ばされる可能性が高くなることがわかります。輸送率。ただし、精度を大幅に向上させることができます。
具体的には、このエラー率の改善は、不可逆的なステップを導入することによって実現されます。分子がエネルギーを持って合成経路に入ると、一連のテストを受ける必要があります。テストが失敗すると、分子も失敗します。検査ステップの数が増えるにつれて、最終的には不良品の割合を大幅に削減できます。これは、典型的な多段階の「ギア潤滑」プロセスです。このような分子製造システムは、生産のあらゆるステップを正確に制御し、起こり得るあらゆるエラーを制御することができます。
この原理をよりよく理解するには、実験データを見る必要があります。 tRNA を充電する過程で、アミノ酸合成酵素は高エネルギー中間状態を利用して tRNA とアミノ酸のペアリング精度を向上させます。このプロセス中、エネルギーの入力によりエントリーパスが不可逆になり、誤った生成物が合成チェーンに戻ることが不可能になります。
さらに驚くべきことは、DNA 修復中に、一部の DNA ポリメラーゼが誤ったペアを即座に加水分解できることです。これもまた、ダイナミクスがさまざまな生物学的プロセスで果たす重要な役割を実証しています。
さらに、ホップフィールドの多段階ギア設計のアイデアは、この多段階修正プロセスに理論的なサポートを提供します。修正時間が長くなるにつれてエラー率はさらに低下し、この原理は多くの生化学プロセスで一貫して検証されています。組立ラインのように、作業員はすべての部品を繰り返しチェックします。複数回の検査を通じてのみ、最終製品の品質が保証されます。
現在、科学者たちはこれらのプロセスの背後にある理論にも取り組んでいます。この研究では、生化学ネットワークはそれぞれ異なるが、その合計完了時間(初回通過時間とも呼ばれる)は普遍的な指数関数形状に近づくことが多く、これにより運動補正に対するより深い理解が得られることが判明しました。このパターンは、ネットワークがより複雑になるにつれて当てはまり、エラー訂正の性質の謎が残ります。
タンパク質合成プロセスについての理解が深まるにつれて、科学者は生命の基本的なメカニズムを再検討することになるかもしれません。この研究がさらに進展すれば、生物分子間のコミュニケーション能力をさらに発見し、生命の正確な機能の謎をさらに解明できるでしょうか?