微生物学の世界では、よく名前が挙がるのが大腸菌(Escherichia coli、通称大腸菌)です。日常生活では食中毒や腸疾患の原因となることが多い細菌ですが、実は科学研究においても重要なモデル生物です。大腸菌は広範囲に分布し、急速に増殖し、多様性に富んでいるため、バイオテクノロジーおよび微生物学の研究に最適です。
大腸菌は、細菌界で最も広範囲に研究されている原核生物のモデル生物です。
この細菌は温血動物の腸内に自然に存在し、そのほとんどの株は人間にとって無害であるか、有益ですらあります。これらは腸内の微生物組成の約 0.1% を占め、宿主によるビタミン K2 の合成を助け、有害な病原菌の定着を防ぎます。このため、大腸菌と人体の間には相互的な生物学的関係が形成され、相互利益の共生が実現されています。
ただし、すべての大腸菌株が友好的であるわけではありません。一部の病原菌株 (EPEC や ETEC など) は重篤な食中毒を引き起こす可能性があり、その主な感染経路は糞口感染です。これらの病原性細菌の存在により、大腸菌は環境サンプル中の糞便汚染を検出するための指標微生物の 1 つにもなります。近年、科学者たちは、宿主の外でも数日間生存できる丈夫な環境の大腸菌を集中的に研究している。
大腸菌は実験室で簡単かつ安価に増殖できるため、1980 年代以降、分子生物学および遺伝子工学研究の基礎となっています。大腸菌の増殖速度は、好条件下では 20 分に 1 回という速さになるため、研究者はさまざまな実験に十分なサンプルを短時間で入手できます。
大腸菌のゲノムは、他の細菌と比較して顕著な多様性を示します。
生物学および生化学の観点から見ると、大腸菌は多様な代謝能力を発揮し、さまざまな基質上で生存し、エネルギー獲得のために混酸発酵を利用することができます。このような特徴により、大腸菌は柔軟な細菌モデルとなるだけでなく、その遺伝子制御や代謝経路を研究するための豊富な情報も提供されます。
大腸菌には「代謝阻害」と呼ばれる現象もあり、これにより細菌は複数の糖源に直面したときに最も早く成長する糖を優先し、それによって限られた代謝資源を効率的に利用します。また、大腸菌の細胞周期は3段階に分かれており、栄養が十分にあると増殖速度が著しく高まります。
遺伝子の水平伝播や細菌の共形質導入などのプロセスを通じて、大腸菌はその遺伝的適応性を実証しており、これにより変化する環境でも生存できるようになるだけでなく、新たな病原体株の形成も促進されます。研究によると、ほとんどの病原性大腸菌は遺伝子導入によって出現します。
大腸菌の多様性と革新性により、大腸菌は真菌と細菌の研究の中心地となっています。
ゲノミクスの急速な進歩により、1997 年に大腸菌の完全なゲノム配列が初めて解読され、科学研究におけるこの細菌の重要な地位が示されました。その後数年で、数百の異なる大腸菌株のゲノムが分析され、研究者らはゲノムの可塑性と多様性が大きな科学的価値を示していることを発見しました。
要約すると、微生物学およびバイオテクノロジー研究のモデルとしての大腸菌は、微生物生物学への理解を深めてくれるだけでなく、遺伝子工学や生物医学への応用に多くの新しい方向性を切り開いてくれます。しかし、この細菌の使用は、将来の科学研究において地球規模の健康と環境問題を解決するために、大腸菌の特性をどのようにうまく利用できるかということを私たちに考えさせることにもなります。