Étude de corrélation temporo-spatiale de la clonalité T dans le mycosis fongoïde par Next Generation Sequencing

Abstract

Introduction Le diagnostic du mycosis fongoide (MF) peut se reveler difficile aux stades initiaux. L’identification en biologie moleculaire d’un clone T cutane dominant peut aider au diagnostic dans environ 60\xa0% des cas. Cependant, l’identite dans le temps et dans l’espace des clones identifies chez un patient donne n’a pas ete evaluee dans cette affection. Cette etude vise a comparer le profil clonal sur differents prelevements dans le temps et l’espace au sein d’une serie retrospective de MF par la technique de Next Generation Sequencing (NGS) qui permet de comparer directement les sequences des rearrangements du TCR, afin de mettre eventuellement en evidence une evolution clonale. Materiel et methodes L’etude a ete menee sur des patients atteints de MF de tous stades chez lesquels au moins 2\xa0biopsies cutanees d’archive separees dans le temps ou synchrones etaient disponibles et chez qui une population clonale T dominante a ete identifiee par des techniques de routine sur au moins une biopsie. Pour chaque biopsie, une etude moleculaire du TCRG en NGS et en PCR-GeneScan® a ete realisee. En cas de rearrangement clonal different mais portant sur les memes regions V du TCRG, des arbres phylogenetiques ont ete etablis afin d’identifier un eventuel phenomene de derive clonale. Pour chaque biopsie, les donnees cliniques et histologiques ont par ailleurs ete revues. Resultats Dix-neuf biopsies issues de 8\xa0patients ont ete etudiees dont 4\xa0patients avec des biopsies successives et 4\xa0avec des biopsies synchrones. En NGS, au moins un rearrangement clonal a ete trouve dans 16\xa0biopsies sur 19\xa0vs 13\xa0en PCR-GeneScan® ce qui confirme une meilleure sensibilite du NGS. Pour 6\xa0patients sur 8 (3\xa0dans le temps et 3\xa0dans l’espace), le profil clonal etait identique. Chez un patient l’emergence massive d’un clone issu d’un phenomene de derive clonale a ete mise en evidence sur 2\xa0biopsies successives, correspondant a une aggravation clinique. Pour un patient aucun clone n’a ete retrouve ni en NGS ni en PCR-GeneScan® sur des lesions synchrones a un stade precoce de la maladie. Il existait une bonne correlation entre NGS et PCR-GeneScan® concernant les regions du TCRG impliquees dans les rearrangements identifies. Chez 3\xa0patients, plusieurs rearrangements ont ete retrouves utilisant les memes genes V du TCRG. Pour 2\xa0de ces 3\xa0patients, un phenomene de derive clonale a ete retrouve entre les clones identifies. Conclusion Cette etude pilote et inedite montre que dans le MF le profil clonal est le plus souvent strictement identique sur le plan moleculaire sur des lesions distantes synchrones et stable dans le temps. Toutefois des derives clonales sont possibles, qui pourraient etre associee a un plus mauvais pronostic. Des etudes prospectives de plus grande ampleur sont necessaires pour evaluer ce point et confirmer ces premiers resultats.