TEKNIK PCR ITS-RFLP UNTUK SELEKSI ISOLAT JAMUR PADA PENGUJIAN AGEN PENGENDALI HAYATI PADA SERANGAN GANODERMA TANAMAN Acacia mangium

Abstract

Penelitian mengenai keragaman jenis jamur pada suatu habitat serta identifikasi jenis jamur banyak dilakukan untuk berbagai keperluan, misalnya untuk mencari sumber obat baru serta\xa0 mencari dan mengembangkan jenis-jenis jamur yang berpotensi sebagai agen pengendali hayati (APH). Pengembangan jenis-jenis APH banyak juga dilakukan untuk mengatasi penyakit pada tanaman hutan. Pada pengembangan APH ini diperlukan pengujian aktivitas pengendalian secara in vivo dari setiap kandidat APH untuk mengetahui efektifitasnya. Pengujian ini memerlukan identifikasi jenis jamur yang ditemukan pada organ tanaman uji. Salah satu metode yang dipakai untuk identifikasi jenis jamur pada uji aktifitas pengendalian APH yaitu dengan melakukan pembuatan kultur\xa0 pada media buatan serta melakukan identifikasi jenis setiap kultur jamur. Identifikasi jenis jamur dapat dilakukan berdasarkan karakter morfologi ataupun karakter genetik dari kultur jamur. Banyaknya isolat jamur yang dihasilkan dari uji aktifitas pengendalian APH memerlukan biaya dan waktu yang tinggi dalam proses identifikasinya. Untuk itu diperlukan suatu cara yang efisien untuk menyeleksi isolat jamur sehingga jenis-jenis jamur tersebut dapat diidentifikasi dengan cepat dan ekonomis. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui potensi marka molekuler PCR ITS-RFLP dalam proses seleksi awal isolat jamur sebelum dilakukan identifikasi berdasarkan sekuens DNA dan untuk memilih enzim restriksi yang memproduksi pola PCR ITS RFLP yang polimorfik. Tiga enzim restriksi ( DraI, EcoRI dan HinfI ) dapat memisahkan 8 isolat jamur yang digunakan dalam penelitian ini menjadi tiga kelompok sesuai dengan profil PCR ITS DNA , sedangkan 5 enzim yang lain ( BamHI, BclI, HaeII, HpaI, dan HindIII ) tidak dapat memotong fragmen DNA ITS, kecuali pada satu isolat jamur saja.