Archive | 2021
Farklı Konukçu Bitkilerden İzole Edilen Agrobacterium tumefaciens İzolatlarının Fenotipik ve Genotipik Karakterizasyonu
Abstract
Bu calismada, 2008-2011 yillari boyunca 4 farkli ilde 10 farkli konukcu bitkiden tipik ur belirtisi gosteren enfekteli bitki ornekleri toplanmistir. Toplanan enfekteli bitki dokularindan toplam 174 bakteri izolati elde edilmistir. Elde edilen izolatlarin patojenisite testlemeleri havuc (Daucus carota L.) dilimi, kalonse (Kalanchoe daigremontiana), domates (Solanum lycopersicum L.) ve aycicegi (Helianthus annus L.) fideleri uzerinde yapilmistir. Patojenisite testleri sonucunda 414 re-izolat elde edilmis olup, bu izolatlar arasindan 138 re-izolat detayli calismalarda kullanilmak uzere secilmistir. Secilmis olan tum izolatlar klasik ve molekuler yontemlerin sonuclarina gore Agrobacterium tumefaciens olarak teshis edilmistir. Test edilen 138 izolat ve 6 referans izolatin tamami kalonse bitkisi ve havuc dilimi uzerinde tipik ur belirtilerine neden olurken, bu izolatlar arasindan 67 izolat domates bitkisinde, 61 izolat ise aycicegi bitkisi uzerinde tipik ur belirtisi olusturamamistir. Bu tez kapsaminda 3-ketolaktoz uretimi, % 2’lik NaCl’de buyume, 35oC’de gelisme, litmus milk’de reaksiyon, eritritol ve melezitozdan asit olusturma, malonik asit, L-tartarik asit ve mucic asitten alkali olusturma, demir amonyum sitrat kullanimi, sitrat kullanimi, PDA+CaCO3 besiyerinde asit temizleme, potasyum hidroksit testiyle gram reaksiyon ve oksidaz testi kullanilmistir Yapilan morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal testlere gore, test edilen izolatlardan 3 tanesi disinda, izolatlar arasinda onemli farklilik gozlenmemistir. Bu izolardaki farklilikta sozkonusu138 izolat arasindan 48 izolat detayli calismalar icin secilmis, genetik profilleri REP PCR, ERIC PCR, BOX PCR ve RFLP teknikleri kullanilarak analiz edilmistir. Bildigimiz kadariyla, seftali, erik, kiraz, armut, trabzon hurmasi, mese ve kalonse bitkilerinden bu etmenin ulkemizdeki varligi ilk kez bu calismayla ortaya konmustur. Elde edilen sonuclar farkli konukculardan elde edilen Agrobacterium. tumefaciens izolatlarinin benzerlik ve farkliliklarini ortaya koymustur. Sonuc olarak, 5 ana grupta, 8 farkli kume ve 26 ozgun profile sahip 34 genotip belirlenmistir. Izolatlar ile konukcu bitki ve cografik bolge arasinda iliski kurulamamistir.