No mundo da biologia, o DNA e o RNA são como dois amigos, que confiam um no outro e dialogam sobre a vida e o destino. No centro desta conversa está o processo de transcrição, que desvenda a vida e define o modo de ser de um organismo. À medida que a tecnologia do transcriptoma avança, os investigadores conseguem obter uma compreensão mais profunda de como este processo afecta a expressão genética, moldando em última análise as características de cada organismo.
O processo de transcrição é uma etapa fundamental na qual o DNA converte sua informação genética em RNA. Este processo não é apenas o ponto de partida das formas de vida, mas também a raiz das funções das células vivas.
Os avanços na tecnologia do transcriptoma nos permitem capturar instantâneos de todo o RNA de uma célula, permitindo-nos entender quais processos celulares estão em andamento e quais estão inativos. Esta tecnologia pode ser vista como uma revolução na biologia. Desde as primeiras tentativas na década de 1990, os cientistas desenvolveram e melhoraram sucessivamente a tecnologia, tornando o transcriptoma uma parte integrante da ciência biológica.
Já em 1991, foi publicado o primeiro estudo parcial do transcriptoma humano. Este trabalho pioneiro relatou 609 sequências de mRNA do cérebro humano. Então, em 2008, os cientistas publicaram dois transcriptomas humanos contendo milhões de sequências transcritas, marcando o rápido desenvolvimento deste campo.
No entanto, o transcriptoma não se desenvolveu da noite para o dia. Já na década de 1970, os cientistas começaram a estudar transcrições individuais, incluindo o uso da transcriptase reversa para converter o mRNA do silkmoth em DNA complementar. No entanto, foi somente em meados da década de 1990 que a tecnologia de microarranjos e o sequenciamento de RNA de alto rendimento (RNA-Seq) se difundiram, transformando o campo.
O desenvolvimento de transcriptomas permite aos biólogos estudar como a expressão genética muda em diferentes organismos e nos ajuda a compreender as doenças humanas.
As principais tecnologias para a pesquisa moderna do transcriptoma incluem microarranjos e RNA-Seq. A tecnologia de microarray permite a detecção simultânea de milhares de transcrições, enquanto o RNA-Seq adquire informações sobre todo o transcriptoma por meio de sequenciamento de alto rendimento, possibilitando a captura de informações transcricionais abrangentes.
O desenvolvimento de microarranjos começou em 1995, quando os cientistas conseguiram projetar uma série de sondas oligonucleotídicas capazes de detectar transcrições específicas. A tecnologia RNA-Seq tornou-se cada vez mais popular com o surgimento da tecnologia de sequenciamento 454. A vantagem desta tecnologia é que ela pode fornecer maior sensibilidade e maior faixa dinâmica, permitindo a detecção simultânea de RNA de baixa abundância.
No RNA-Seq, a abundância de mRNA é determinada pela contagem das transcrições correspondentes. A ascensão desta tecnologia substituiu rapidamente os microarranjos e se tornou a corrente principal da tecnologia de transcriptoma atual.
Todo experimento de transcriptoma deve extrair RNA do organismo. Normalmente, as amostras são primeiro tratadas mecanicamente e quimicamente para remover eficazmente as impurezas e isolar o mRNA. Posteriormente, o RNA extraído será transcrito reversamente para gerar DNA complementar, e futuros experimentos poderão utilizar EST (Expressed Sequence Tag) e SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) para obter dados relacionados à transcrição.
É claro que os métodos atuais de análise de dados estão se tornando cada vez mais maduros. O surgimento de muitas ferramentas de computação e bancos de dados permite aos pesquisadores extrair rapidamente informações significativas de dados massivos, revelando assim a regularidade da expressão genética e dos mecanismos biológicos.
A análise da expressão genética global de um organismo pode detectar tendências amplas e coordenadas que não seriam visíveis através de testes mais direcionados.
Com a crescente maturidade da tecnologia do transcriptoma, as pessoas agora não estão limitadas à análise da expressão genética global, mas também podem visualizar a informação transcricional de células individuais, o que nos dá uma compreensão mais profunda dos processos biológicos dentro das células.
Olhando para o futuro, a tecnologia do transcriptoma continuará a evoluir e a desempenhar um papel em mais campos. O desenvolvimento da tecnologia de edição genética, juntamente com pesquisas aprofundadas sobre transcriptômica, pode levar a novas formas de tratar doenças humanas. No entanto, também precisamos de pensar se podemos encontrar um equilíbrio harmonioso entre estas tecnologias biológicas e os nossos limites morais?