Language
Country/Area
No result found
O maravilhoso mistério dos marcadores RAD: como usar mapas genéticos para revelar o mistério da evolução das espécies?
No vasto oceano da biologia, os mapas genéticos são como ilhas invisíveis, esperando que os cientistas os explorem. O surgimento de marcadores de DNA associados ao sítio de restrição (RAD) fornece uma nova perspectiva e ferramenta para o estudo da evolução das espécies. Este marcador genético não apenas mostra sua importância no mapeamento de associação, mapeamento de QTL e genética ecológica, mas também abre caminho para a exploração da genética evolutiva.
Conceitos básicos da marcação RAD
Marcadores de DNA associados a sítios de restrição são uma ferramenta genética que auxilia no gerenciamento de recursos e na conservação da biodiversidade. Esses fragmentos de DNA estão localizados no genoma perto de enzimas de restrição específicas. Para conduzir estudos de marcação RAD, primeiro você precisa isolar essas marcações RAD, que são sequências de DNA que circundam locais de restrição específicos no genoma.
A tecnologia de marcação RAD tem sido estudada e aplicada em muitos níveis, especialmente na evolução das espécies, e sua importância não pode ser subestimada.
Processo de isolamento de tags RAD
O processo de isolamento de marcadores RAD fornece a base para a identificação de variantes genéticas. O processo começa pela digestão do DNA com enzimas de restrição específicas e pela ligação de adaptadores biotinilados às extremidades do DNA. O DNA é então cortado aleatoriamente, e esferas de estreptavidina são usadas para isolar os fragmentos biotinilados. Recentemente, esse procedimento também foi revisado para utilizar sequenciamento de alto rendimento para análise, um método que melhorou muito a precisão e a eficiência.
Identificação e genotipagem de marcadores RAD
Após isolar a etiqueta RAD, os cientistas podem então identificar e genotipar polimorfismos de sequência de DNA, particularmente polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs). Esses sítios polimórficos são chamados de marcadores RAD e permitem que os pesquisadores obtenham uma compreensão profunda da estrutura genética de uma espécie e de sua história evolutiva.
O desenvolvimento do sequenciamento de DNA de alto rendimento proporcionou possibilidades e densidade de dados sem precedentes para a identificação de marcadores RAD.
História da Marca RAD
Os marcadores RAD foram inicialmente desenvolvidos por meio da tecnologia de microarray, mas com o surgimento da tecnologia de sequenciamento de alto rendimento, sua aplicação se tornou cada vez mais extensa. Desde 2006, os laboratórios Eric Johnson e William Cresko da Universidade do Oregon desenvolveram em conjunto essa tecnologia e demonstraram a eficácia dos marcadores RAD na identificação de pontos de interrupção de recombinação genética e detecção de QTL.
O surgimento da tecnologia ddRADseq
Em 2012, cientistas propuseram um método aprimorado chamado marcação RAD de dupla digestão (ddRADseq). Essa abordagem permite a combinação de duas enzimas de restrição e adiciona um rigoroso processo de triagem de tamanho de DNA, fornecendo uma solução eficiente para genotipagem populacional de baixo custo.
Tecnologia hyRAD e sua importância
Em 2016, o surgimento da tecnologia hyRAD indicou que o escopo da rotulagem RAD está se expandindo. Este método usa fragmentos RAD biotinilados como sondas de alinhamento para capturar fragmentos homólogos no genoma. Isso é particularmente importante para estudar informações genéticas em amostras contaminadas ou degradadas, como é o caso agora com espécimes de museu que usam essa técnica.
A tecnologia hyRAD não apenas compensa a dependência de locais de restrição, mas também melhora muito a cobertura do local em todas as amostras.
Conclusão
Por meio da evolução das tecnologias, marcadores RAD e métodos relacionados estão revelando os mistérios da evolução das espécies. Isso não apenas enriquece a conotação da genômica, mas também acelera o ritmo da conservação da biodiversidade. Em pesquisas futuras, como usar essas tecnologias de forma mais eficaz se tornará uma questão urgente a ser resolvida pelos cientistas.
