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Por que o mNGS é um super-herói quando se trata de diagnosticar infecções?
Com o avanço da tecnologia, os métodos tradicionais de diagnóstico de patógenos estão enfrentando desafios sem precedentes. O sequenciamento genômico metabólico clínico de próxima geração (mNGS) tem gradualmente mostrado suas vantagens únicas, especialmente no diagnóstico de doenças infecciosas complexas. Suas capacidades de detecção abrangentes o tornam tão importante quanto um super-herói.
O que é mNGS?O sequenciamento de última geração da genômica metabólica clínica oferece a possibilidade de detecção abrangente de patógenos potenciais, o que é particularmente valioso quando os métodos tradicionais são difíceis de usar.
mNGS refere-se à análise de material genético (DNA ou RNA) de microrganismos e hospedeiros em amostras clínicas por meio de tecnologia de sequenciamento de última geração, sem a necessidade de conhecer o patógeno específico. Uma vantagem fundamental dessa abordagem é sua capacidade de detectar múltiplos patógenos simultaneamente, principalmente quando outros métodos de detecção mais direcionados (como PCR) falham.
Fluxo de trabalho do laboratório
O fluxo de trabalho típico do mNGS inclui coleta de amostras, extração de RNA/DNA, preparação de estoque, sequenciamento de alto rendimento e análise bioinformática. A qualidade da coleta da amostra afeta diretamente os resultados do teste, por isso ela deve ser realizada com cautela.
Coleta e extração de amostras
As fontes de amostra mais comumente usadas incluem sangue, fezes, líquido cefalorraquidiano (LCR), urina e swabs nasofaríngeos. Ao extrair amostras, escolha o kit de extração apropriado para excluir interferências de fundo e se concentrar no RNA ou DNA do patógeno.
Preparação de estoque e sequenciamento de alto rendimento
Devido à influência do ruído de fundo, estratégias para aumentar os sinais de patógenos são particularmente importantes. A escolha da plataforma de sequenciamento de alto rendimento depende dos objetivos da pesquisa e da experiência do laboratório. Atualmente, o sistema Illumina MiSeq é a escolha mais comum, mas tecnologias emergentes como MinION também mostram grande potencial.
A melhoria da tecnologia de sequenciamento de alto rendimento tornou o monitoramento sensível ao tempo e as aplicações epidemiológicas de várias causas desconhecidas mais imediatos e precisos.
Aplicações do mNGS
mNGS mostra potencial significativo no diagnóstico de doenças infecciosas, especialmente para patógenos que não podem ser localizados por métodos tradicionais de detecção. Por exemplo, o mNGS supera os testes microbiológicos tradicionais no diagnóstico de meningite e encefalite.
Estudo da resistência aos antibióticos
À medida que a resistência aos antibióticos se torna um problema crescente, o mNGS fornece uma nova maneira de detectar e caracterizar esses genes, ajudando a comunidade médica a entender e enfrentar melhor esse desafio.
Desafios e Perspectivas Futuras
Embora o mNGS tenha aplicações em vários campos, desafios como sua utilidade clínica, validade laboratorial e economia ainda precisam ser enfrentados. Muitos estudos ainda estão na fase de relato de caso e carecem de ampla aplicação clínica.
ConclusãoNo futuro, se os desafios atuais puderem ser superados, o mNGS demonstrará seu valor indispensável na saúde pública e na prevenção e controle de epidemias.
Com a demanda por ferramentas de diagnóstico rápido aumentando cada vez mais, a mNGS se tornará uma prática mais comum e padrão no diagnóstico de doenças infecciosas no futuro?
