Нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD) — это путь наблюдения, присутствующий у всех эукариот. Его основная функция — уменьшать дефекты экспрессии генов путем устранения транскриптов мРНК, содержащих преждевременные ошибки стоп-кодонов. Этот процесс имеет решающее значение для снижения производства вредных белков, возникающих в результате трансляции этих аберрантных мРНК. Открытие NMD датируется 1979 годом, когда он был описан в эукариотических клетках и дрожжах почти одновременно, что указывает на то, что этот механизм широко консервативен в эволюции и имеет важное биологическое значение.
Этот механизм устраняет неожиданно низкие концентрации мРНК, вызванные ранними стоп-кодонами, транскрибируемыми на аллелях.
В процессе НМД в основном участвуют несколько ключевых белков. У дрожжей Saccharomyces cerevisiae к основным трем факторам относятся UPF1, UPF2 и UPF3 (соответствующие у человека — UPF3A и UPF3B). Эти факторы образуют консервативное ядро пути NMD. Когда мРНК подвергается сплайсингу, UPF2 и UPF3 становятся частью сплайсированного комплекса экзон-экзон (EJC) и связываются с мРНК.
Процесс обнаружения НМД происходит во время трансляции мРНК. Если после первого раунда трансляции белок EJC все еще связан с мРНК, NMD будет активирован.
На эффективность пути NMD влияют различные молекулярные характеристики. В исследованиях NMD были обнаружены некоторые основные молекулярные правила, такие как модель EJC, эффект близости инициации, длина экзона и расстояние от раннего стоп-кодона до нормального стоп-кодона и т. д., которые будут влиять на реакцию NMD на аномальную мРНК. . Признание и деградация эффективности.
Например, если ранний стоп-кодон расположен выше последнего EJC, NMD обычно срабатывает, но если он расположен ниже, NMD обычно будет менее эффективным.
Хотя существование NMD может эффективно уменьшить количество неправильных кодонов, мутации все равно могут вызывать проблемы со здоровьем. Например, бета-талассемия вызвана мутациями выше гена бета-глобина. У лиц только с одним затронутым аллелем обычно наблюдаются очень низкие уровни мутантной мРНК β-глобина.
Эти мутации также могут привести к возникновению синдрома Марфана, который обусловлен мутациями в гене фибриллина 1, а его фенотипические эффекты тесно связаны с НМД.
Кроме того, NMD также участвует в регуляции иммуногенных антигенов, вызванных мутацией сдвига рамки считывания. Мутации сдвига рамки считывания приводят к образованию аномальных белков, которые часто распознаются иммунной системой как неоантигены. Однако эти мутации могут также приводить к активации NMD, тем самым снижая экспрессию этих аномальных мРНК.
Важность NMD в регуляции генов делает его новой областью исследований. Изучая НМД, ученые смогут найти причины некоторых генетических заболеваний и дополнительно изучить механизмы дозовой компенсации у млекопитающих.
Например, было обнаружено, что мутации в гене POMC связаны со многими метаболическими процессами и влияют на регуляцию массы тела.
Наконец, правила NMD также имеют решающее значение при планировании экспериментов CRISPR-Cas9, поскольку эти эксперименты могут привести к мутациям со сдвигом рамки и образованию ранних стоп-кодонов.
По мере того, как мы получаем более глубокое понимание механизмов НМД и его биологического значения, эта область может раскрыть еще больше загадок регуляции экспрессии генов. Задумывались ли вы когда-нибудь, может ли НМД стать новым направлением в лечении заболеваний, связанных с генетическими мутациями?