Благодаря быстрому развитию геномики учёные всё чаще получают представление о генетической истории человека. С помощью генетического анализа можно проследить общих предков разных людей на протяжении тысячелетий. Возникает интересный вопрос: как можно проследить происхождение двух людей от одного и того же предка? В этой статье мы рассмотрим научные принципы, лежащие в основе этого, особенно то, как «теория общего происхождения» помогает нам понять процесс генетического наследования.
Теория общего происхождения – это модель, описывающая, как аллели в популяции происходят от общего предка. В простейшем случае он предполагает отсутствие рекомбинации, естественного отбора, потока генов или структуры популяции, а это означает, что каждая вариация с равной вероятностью будет передаваться от одного поколения к другому. Эта модель работает в обратном направлении во времени, объединяя аллели в соответствии со случайным процессом до тех пор, пока не будет сформирована общая предковая копия.
В соответствии с этой моделью ожидаемое время общего предка увеличивается почти экспоненциально с каждым последующим поколением и сильно варьируется.
На примере одного локуса гена, взятого у двух гаплоидных особей, мы можем проследить его предков до самого недавнего общего предка (MRCA). Теория общего происхождения стремится оценить ожидаемые сроки этого периода и его вариации. Если в популяции с эффективным размером популяции Ne
есть потенциальные родители 2Ne
, то вероятность того, что две родословные имеют общего предка в предыдущем поколении, равна 1/ ( 2Не)код>.
Эти расчеты помогают нам понять, как гены передаются из поколения в поколение, и выявить, как гены связаны между собой.
Теорию общего происхождения также можно использовать для моделирования степени вариаций последовательностей ДНК, ожидаемых в результате генетического дрейфа и мутаций. Эту величину называют средней гетерозиготностью. Его расчет учитывает вероятность возникновения мутации в одном поколении и вероятность любого «события» (мутации или совместного происхождения).
Когда
4Neμ ≫ 1
, подавляющее большинство пар аллелей имеют хотя бы одно различие в нуклеотидной последовательности.
В таких областях, как локализация генетических заболеваний, потенциал теории общего происхождения постепенно привлекает внимание. Хотя практическое применение этой теории все еще находится в зачаточном состоянии, многие исследователи работают над разработкой алгоритмов анализа генетических данных человека с использованием теории общего происхождения.
Используя генеалогическое древо, исследователи могут отслеживать генетические маркеры, связанные с конкретными заболеваниями, и понимать, как эти гены наследуются.
Картирование однонуклеотидного полиморфизма (SNP) человека выявляет региональные различия в генетической гетерозиготности, которые не просто случайны, но и находятся под влиянием популяционной генетики. Некоторые локусы могут иметь относительно недавнего общего предка, тогда как другие могут иметь более старые генеалогические древа.
Теория общего предка является естественным продолжением концепции нейтральной эволюции в классической популяционной генетике и была независимо открыта многими исследователями в 1980-х годах. С развитием технологий в настоящее время существует множество программ, которые можно использовать для моделирования наборов данных в рамках процесса общего происхождения и для определения таких параметров, как размер популяции и скорость миграции, на основе генетических данных.
Ученые работают над тем, чтобы использовать эти инструменты, чтобы глубже понять, как гены влияют на наше здоровье и риск заболеваний.
С дальнейшим развитием генетики понимание и применение теории общего происхождения будут становиться все более важными. Эта теория не только помогает нам разгадать генетические загадки прошлого, но и выявляет возможные проблемы со здоровьем в будущем. Следующий вопрос: сколько неизвестных общих предков ждет нас в этой сети генетических связей?