Скрытые сокровища природы: почему ДНКзимы так редки и ценны?

<р> Дезоксирибозим, или сокращенно ДНКзим, постепенно привлекает широкое внимание научного сообщества. Хотя эта уникальная молекула ферментного типа может катализировать химические реакции, в природе она встречается довольно редко. По сравнению с другими ферментами, такими как белки и РНК-ферменты, дезоксирибозимы имеют короткую историю открытия, и практически нет никаких свидетельств их существования в природе. Это делает ДНКзимы скрытым сокровищем в современных биохимических исследованиях.

Дезоксирибозимы не только являются катализаторами, но и могут стать ключом к изучению происхождения жизни и биохимии. Их пустые записи неоднократно бросали вызов познаниям ученых.

<р> Редкость ферментов ДНК по сравнению с обилием белковых ферментов и ферментов РНК, открытых в биологии в 1980-х годах, позволяет сделать глубокие выводы. Структура ДНК ограничивает ее каталитическую способность. В частности, по сравнению с функциональным разнообразием белков, четыре нуклеотидные структуры дезоксирибозы относительно просты, что делает ее каталитический эффект недостаточным.

Из-за ограниченного числа основных метаболических компонентов дезоксирибозимы ограничены тремя типами взаимодействий в каталитических реакциях: водородными связями, π-стэкингом и координацией ионов металлов.

<р> С одной стороны, отсутствие РНК-специфической 2'-гидроксильной группы в дезоксирибозе еще больше ослабляет потенциал ДНК как катализатора. С другой стороны, структура двойной спирали ДНК подавляет ее способность образовывать высокогибкую третичную структуру, что делает ее каталитический эффект изначально ограниченным. Тем не менее, существование ДНКзимов по-прежнему доказывает их ценность и способность демонстрировать превосходную каталитическую эффективность в некоторых конкретных средах.

Типы ДНКзимов

<р> Ферменты ДНК могут выполнять различные химические реакции, наиболее известным типом которых являются рибонуклеазы. Эти молекулы катализируют расщепление связей нуклеотидных эфиров и образуют циклические фосфатные концы. С 1994 года ученые начали изучать этот тип молекул и открыли несколько типов дезоксирибозимов, включая GR-5. Эти ферменты можно модифицировать с помощью различных металлических кофакторов для изменения их каталитических свойств, что еще больше расширяет возможности их применения.

Как и у первого открытого фермента ДНК, GR-5, его каталитическая способность превысила некатализируемую реакцию в 100 раз, что раскрыло удивительный потенциал этих биомолекул.

Скрининг и эволюция

<р> Поскольку дезоксирибозимы редко встречаются в природе, ученые обычно открывают новые дезоксирибозимы с помощью методов скрининга in vitro. Эти методы скрининга аналогичны методу SELEX, который использует пулы синтетических случайных последовательностей ДНК для фильтрации молекул с определенной каталитической активностью. Благодаря постоянному совместному отбору и расширению скрининга исследователи смогли провести скрининг эффективных последовательностей ДНКзимов, что подчеркивает важную роль этого процесса в биохимических исследованиях.

Перспективы применения

<р> С развитием технологий ДНКзимы нашли применение во многих областях, включая подавление вирусов, лечение рака и обнаружение металлов. Исследования показали, что дезоксирибозимы могут эффективно подавлять распространение вирусов гриппа, коронавирусов и многих других патогенов, а также продемонстрировали потенциальный терапевтический эффект в клинической практике.

Последние исследования показывают, что ферменты ДНК, воздействующие на определенные факторы транскрипции генов, могут значительно улучшить реакцию пациентов на такие заболевания, как астма.

Заключительные мысли

<р> Открытие и применение дезоксирибозимов не только обогащают наше понимание биокатализа, но и открывают новые перспективы для изучения происхождения жизни. По мере углубления исследований ДНКзимы могут играть более важную роль в биомедицине и биотехнологиях в будущем. Какие сюрпризы и открытия принесут нам эти сокровища, скрытые в природе?

Trending Knowledge

Удивительный секрет ферментов ДНК: почему эти ДНК могут стать «химическими волшебниками» природы?
В микроскопическом мире жизни в области химических реакций часто доминируют различные ферменты. Среди всех этих загадочных биокатализаторов большое внимание ученых привлекли дезоксирибозимы благодаря
Загадочная двойственность ДНК: в чем разница между дезоксирибазой и РНКазой?
В биологических системах ферменты — это важные молекулы, которые облегчают химические реакции. Хотя мы обычно фокусируемся на белковых ферментах и ​​РНКазах, в последние годы постепенно стали появлять
Невоспетый герой химических реакций: как в лаборатории была обнаружена дезоксирибаза?
В мире биохимии роль ферментов очевидна. Однако когда речь заходит о ферментах ДНК, или дезоксирибонуклеазах, исследования в этой области кажутся относительно загадочными. Дезоксирибозимы не только ка

Responses