Голофермент, особенно голостерический фермент, является очень важным понятием в биохимии. Эти ферменты способны изменять свою конформацию при связывании эффектора (регулятора), тем самым влияя на их сродство к другому участку связывания лиганда. Это явление, известное как «действие на расстоянии», показывает, как различные регуляторные механизмы могут влиять на различные физиологические процессы внутри клеток. р>
Суть регуляции холоферментов заключается в том, что связывание одного лиганда может влиять на связывание другого лиганда, что является сутью холостерической концепции. р>
Холаза играет ключевую роль в основных биологических процессах, таких как клеточная сигнализация и регуляция метаболизма. Холостерическая регуляция больше не ограничивается ферментами в нескольких системах; многие системы подтвердили голостерические свойства отдельных ферментов. В то же время наличие полноценного стерического сайта позволяет эффекторам связываться с белком, что обычно вызывает динамические конформационные изменения в белке. Это преобразование может увеличить активность фермента, и эти эффекторы называются голостерическими активаторами, тогда как противоположное явление называется голостерическими ингибиторами. р>
Гомостерическая регуляция отображает контуры управления, встречающиеся в природе, такие как обратная связь от нижестоящих продуктов или прямая связь от вышестоящих субстратов. Голостерические эффекты дальнего действия особенно важны в клеточной сигнализации, где такая регуляция помогает клеткам корректировать активность ферментов в ответ на изменения окружающей среды. р>
Определение голостерической регуляции происходит от греческих корней allōs (ἄλλος, что означает «другой») и stereos (στερεὀς, что означает «твердый»), что относится к взаимосвязи между регуляторным участком и активным участком голостерический белок. Физическое различие точки. р>
В многосубъединичном комплексе каталитический фермент (холофермент) может быть временно или постоянно связан с кофактором (например, АТФ). Этот процесс имеет решающее значение, поскольку скорость некатализируемой реакции очень низкая. Оптимизация каталитической активности является основным фактором эволюции белков. Большинство голостерических ферментов имеют несколько связанных доменов/субъединиц и демонстрируют кооперативные связывающие свойства, в результате чего голостерические ферменты обычно демонстрируют сигмоидальную зависимость от концентрации субстрата. р>
Это позволяет большинству голостерических ферментов резко изменять каталитический выход при небольших изменениях концентрации эффектора. р>
Эффектором может быть сам субстрат (гомологичный эффектор) или другая небольшая молекула (гетерологичный эффектор), которая может вызвать ремоделирование фермента путем перераспределения структуры фермента между состояниями с высоким и низким сродством. Становится более активным или менее активны. Участок, где связываются гетерологичные эффекторы, голостерический участок, обычно отделен от активного участка, но термодинамически связан с ним. р>
База данных All-osteric (ASD, http://mdl.shsmu.edu.cn/ASD) предоставляет Централизованный ресурс для отображения, поиска и анализа структуры, функций и связанных с ними сведений о целых стерических молекулах, включая целые стерические ферменты и их регуляторы. Каждый фермент имеет подробное описание его глобальных стерических свойств, биологических процессов и связанных с ними заболеваний, а каждый модулятор содержит информацию о связывающей способности, физико-химических свойствах и терапевтических областях. р>
Эти структурно различные формы ферментов были продемонстрированы в нескольких известных голостерических ферментах, но молекулярная основа трансформации остается не до конца изученной. р>
Для описания этого механизма были предложены две основные модели: «коллаборативная модель» Моно, Уаймана и Шанжо и «последовательная модель» Кошланда, Немети и Филмера. В кооперативной модели считается, что белки имеют два глобальных состояния «все или ничего», и эта модель поддерживается положительным сотрудничеством, поскольку связывание одного лиганда увеличивает способность фермента связывать больше лигандов. С другой стороны, последовательная модель предполагает, что существует несколько глобальных конформационных/энергетических состояний, и каждый раз, когда фермент связывает лиганд, он увеличивает свою готовность связываться с другими лигандами. Однако ни одна из моделей не объясняет полностью глобальное стерическое связывание. Феномен . р>
В последнее время сочетание физических методов (например, рентгеновской кристаллографии, малоуглового рентгеновского рассеяния в растворе и т. д.) и генетических методов (например, направленного мутагенеза) может улучшить наше понимание голостерических . Холоферментная регуляция не только играет ключевую роль, но и оказывает важное влияние на адаптивность многих биологических процессов, что заставляет людей задаваться вопросом: полностью ли мы понимаем роль и значение голоферментной регуляции в жизненных явлениях?