Nonsense-mediated mRNA decay(NMD)是一种在所有真核生物中存在的监测通路,其主要功能是通过消除包含早期终止密码子(premature stop codons)的mRNA转录本来减少基因表达中的错误。这一过程对于减少因翻译这些畸变mRNA而导致的有害蛋白质的产生至关重要。 NMD的发现可以追溯到1979年,当时在真核细胞和酵母中几乎同时被描述,表明这一机制在进化上具有广泛的保守性和重要的生物学意义。
这一机制能够消除在alleles上转录的早期终止密码子带来的意外低浓度mRNA。
NMD的过程主要涉及几个关键蛋白质,其中在酵母Saccharomyces cerevisiae中,主要的三个因素包括UPF1、UPF2和UPF3(在人体中对应的为UPF3A和UPF3B)。这些因子组成了NMD通路的保守核心。当mRNA经过剪接后,UPF2和UPF3会成为剪接后的外显子-外显子接合复合体(EJC)的一部分并与mRNA结合。
NMD的检测过程发生在mRNA翻译的过程中。当第一轮翻译后,若仍有EJC蛋白结合在mRNA上,NMD便会被激活。
NMD通路的效率受到多种分子特征的影响。在有关NMD的研究中,发现了一些核心的分子规则,如EJC模型、起始邻近效应、外显子长度和早期终止密码子到正常终止密码子的距离等,这些都会影响NMD对异常mRNA的识别和降解效率。
例如,若早期终止密码子位于最后EJC上游,NMD一般会被触发,但若其位于下游,则NMD则通常效率较低。
NMD的存在虽然能够有效减少错误密码子,但突变仍然可能导致健康问题。例如,β地中海贫血就是由于β-球蛋白基因上游的突变引起的。只有一个受影响等位基因的个体,通常会体现出极低的突变β-球蛋白mRNA。
这些突变同样可导致Marfan综合征的出现,后者是由于fibrillin 1基因的突变,且其表型影响与NMD密切相关。
此外,NMD也参与了免疫原性框移突变衍生抗原的调控。由于框移突变会导致产生异常蛋白,而这些异常蛋白通常能被免疫系统识别为新抗原。然而,这些突变也可能导致NMD的激活,从而降低这些异常mRNA的表达。
NMD在基因调控中的重要性使其成为研究中的一个新兴领域。通过研究NMD,科学家能够找到某些遗传疾病的原因,并进一步探索哺乳类动物中的剂量补偿机制。
例如,POMC基因的突变被发现与诸多代谢过程有关,并影响体重的调控。
最后,NMD的规则在设计CRISPR-Cas9实验时也至关重要,因为这些实验可能会导致框移突变并产生早期终止密码子。
随着我们对NMD机制及其生物学意义的深入了解,这一领域可能会揭示更多基因表达调控的奥秘。你是否想知道NMD能否成为治疗基因突变相关疾病的新方向?