在遗传学中,增强子是一段短的(50-1500 bp)DNA序列,可以被蛋白质(激活因子)所结合,以提高特定基因转录的可能性。这些蛋白质通常被称为转录因子。增强子是cis-作用的,这意味着它们可以位于基因的上游或下游,距离可达1 Mbp(1,000,000 bp)。人类基因组中有数十万个增强子,这些增强子不仅存在于真核生物中,也存在于原核生物中。他们的存在和功能正在逐步被科学界揭示,尤其是在疾病研究和基因表达的调控中显得尤为重要。
增强子不仅在基因附近发挥影响,甚至能在遥远的位置通过空间性交互来激活相关基因的转录。
增强子的首次发现是在1983年,在免疫球蛋白重链基因中,它位于一个大型内含子中,解释了重排Vh基因启动子的转录激活的机制。而在近几年来的研究中,增强子显示它们在某些医疗条件中扮演着重要角色,例如骨髓抑制。最值得关注的是,从2022年开始,科学家们利用人工智慧设计合成增强子,并应用于动物系统中,展示其在创新研究中的潜力。
在真核细胞中,DNA的染色质结构被折叠成一种模仿原核生物DNA的超螺旋状态,虽然增强子的DNA在线性上可能远离基因,但却在空间上接近启动子和基因,这使得它能够与一般转录因子及RNA聚合酶II进行交互。
增强子不仅能促进基因表达,某些增强子还能在非邻近的染色体上发挥作用。
引人注意的是,增强子可能位于基因的上游或下游,并且这些增强子不需要靠近转录起始位点即可以影响转录。许多研究清楚表明,增强子的激活与特定转录因子的结合密切相关,这些转录因子的存在和活性直接影响目标基因的表达。
在哺乳动物中,基因表达受到多种顺势调控元素的调控,其中包括核心启动子和位于基因转录起始位点附近的促进子。尽管核心启动子能够引导转录的启动,但通常其基底活性较低。与此相对,增强子能够在遥远位置上显著影响基因表达,激活的增强子甚至可以使基因表达提高至100倍以上的水平。
增强子的存在使得特定的基因表达能够根据不同的细胞类型和环境而表现出不同的模式。
在特定组织类型中,增强子会与其所调控的启动子紧密相连,形成一个“环”状结构来促进基因表达,这样的机制在许多神经细胞和组织中都有被确认。
增强子也能在进化过程中发挥关键作用。以HACNS1为例,这个增强子可能促进了人类拇指的演化,而GADD45G增强子则在不同物种中的脑部发育有着不同的影响。这些增强子的变化为生物进化提供了新的视角。
理解增强子的功能和互动,对于解开发育生物学中的许多谜题至关重要。
在发育生物学中,增强子作为cis-调控元件来精确调节基因表达,其作用影响着细胞的发展、分化和成长。
随着基因组学和表观基因组学技术的快速发展,研究者们开始利用高通量技术识别和表征这些关键的cis-regulatory modules(CRM)。然而,在比较基因组学中,即使是与许多物种的序列相比,许多增强子的功能也能在没有主要序列保守性下得以完成,这尤为值得深入研究。
这些新技术的应用为增强子的发现和功能理解提供了前所未有的机会。
未来,随着基因编辑技术的进一步发展,改写或修正增强子的能力将使我们有望在治疗遗传疾病和开发新疗法方面取得重大进展。但我们是否能充分掌握这些增强子在生物适应和演化中的作用,仍然是科学上亟待探索的问题?