在当前的生物技术领域,无细胞系统作为一种特别的工具,正逐渐成为研究生物反应的重要方法。这些系统的主要特点是,它们能够在不使用完整细胞的情况下,研究细胞内发生的各类生物反应,从而简化复杂的细胞内部互动。由于无细胞系统替代了繁杂的生物环境,加上有效的分子机械,这使得它们在合成生物学中发挥了重要作用。
无细胞系统不仅在控制所检测的反应方面具有极大优势,还能实现更高的反应产量。
无细胞系统主要分为两大类型:基于细胞提取的系统和基于纯化酶的系统。前者直接从完整细胞中提取组件进行外部使用,后者则是采用已知生物过程中的纯化成分。例如,以大肠杆菌为基础的细胞提取系统,可能会面临快速降解组件的问题,这在以大肠杆菌为基础的翻译系统中已有案例证明。
这些系统的准备方法因系统类型而异。历史上,诺贝尔奖得主Eduard Buchner是首位使用酵母提取物的科学家,而如今,其他来源如E. coli、小麦胚芽和兔红细胞等也能成功构建无细胞系统。以E. coli 30S提取物为例,通常通过磨碎细菌并经过清洗来获得。
细胞提取的过程可能会面临如膜破裂等挑战,进而影响反应的稳定性和控制性。
无细胞合成途径的生物转化系统,正被提出作为一种低成本的生物制造平台,替代了数千年来的微生物发酵方式。无细胞生物系统在工业应用中具有多项优势,例如可实现极高的产品产量,并且通常不会产生副产品。
例如,利用合成酶途径,从淀粉和水的反应中,每提供一单位的聚糖及水,可以产生近12单位的氢气,这是最佳厌氧产氢微生物理论产量的三倍。
无细胞生物系统的另一个显著优势在于其在增产蛋白质方面的能力。著名的Nirenberg和Matthaei实验便是利用了基于细胞提取的系统,将标记的氨基酸纳入合成的蛋白质中。随着技术的进步,许多研究如Spirin等的研究,利用原核和真核的细胞提取系统实现了更高的蛋白质合成效率。
无细胞系统还能用于代谢过程的工程。 Bujara等人的研究表明,他们利用大肠杆菌的酵解网络提取物,实时分析了一种代谢中间体的浓度,从而获得了最佳的产量。
无细胞系统的另一个突破是它们成功纳入非天然氨基酸的能力。 Shimizu等指导的研究显示,去除释放因子RF1可以将终止密码更改为意义密码,这为在细胞内操作困难的系统提供了可能的解决方案。这使得无细胞系统在一些研究,如多维NMR光谱分析中变得极具价值。
无细胞系统的逐步发展不仅降低了生物制造的复杂性,还提高了生产的效率和灵活性。在未来,这些系统将如何改变我们对生物制造的理解和应用?