生物界的防禦機制之中,RNA干擾(RNA interference, RNAi)是一種極為重要的機制,在對抗病毒及調控基因表達方面,擁有不可或缺的作用。這一機制通過雙鏈RNA(dsRNA)來激活一種多蛋白複合物,稱之為RNA誘導沉默複合物(RISC),從而精確地靶向並降解特定的信使RNA(mRNA)。
RISC是一個複雜的核糖核蛋白(ribonucleoprotein)結構,主要由蛋白質和RNA組成。當細胞發現雙鏈RNA的存在時,RISC會被激活,隨後利用單鏈RNA來識別並結合與之互補的mRNA。RISC中的Argonaute蛋白會然後進行mRNA的切割,這一過程就是RNA干擾的核心機制。
這一機制已被證明在眾多真核生物中普遍存在,尤其是在防禦病毒感染方面扮演著關鍵角色。
RNA干擾的發現可以追溯到1998年,由安德魯·火和克雷格·梅洛首次發現,並因此獲得2006年諾貝爾生理學或醫學獎。而對於RISC本身的生化特徵分析則由格雷戈里·漢農和他的團隊於冷泉港實驗室進行,他們的研究重點是揭示RISC如何以雙鏈RNA實現基因沉默的機制。
RISC的形成涉及到著名的RNase III Dicer,它負責將雙鏈RNA切割成小片段,這些片段包括小干擾RNA(siRNA)和微RNA(miRNA)。這一過程是RNA干擾的第一步,Dicer將前驅體miRNA(pre-miRNA)轉化為能夠被RISC有效利用的功能性RNA。
RISC通常使用miRNA或siRNA的引導鏈來靶向mRNA的3' 非翻譯區(3' UTR),這一過程涉及一些主要的蛋白質,如Ago2、SND1和AEG-1。這些蛋白質共同工作,通過與mRNA的精確配對來控制基因表達。
RNA干擾最明顯的作用是mRNA降解,這一過程下降低了可供翻譯的mRNA水平,從而調控基因表達。
除了降解mRNA外,RISC還可以通過抑制翻譯來調控基因表達。這一過程一般只需引導鏈與目標mRNA有部分序列匹配。RISC能夠干擾翻譯的起始步驟,通過阻止翻譯起始因子結合到mRNA的5'帽子上,進而抑制下游基因表達。
儘管RISC的完整結構尚未完全被揭示,但目前的研究已經發現一些關鍵蛋白質參與其形成與功能。在這些成分中,Argonaute蛋白是RISC的核心組分,負責負責靶向mRNA的切割。此外,RISC裝載複合物(RLC)也是將雙鏈RNA片段裝載進入RISC以實施RNA干擾的重要結構。
Argonaute蛋白在各種真核生物中都有表現,其在RNA干擾中的作用不可或缺。
目前尚不清楚RISC複合物具體如何定位細胞中的mRNA目標,但研究表明這一過程可以在沒有蛋白質翻譯的情況下進行。內源性miRNA有時候與多個基因的匹配並不完美,因此它們主要通過翻譯抑制的方式調控基因表達,這一特性在不同生物之間存在一些變異。
RNA干擾不僅僅是一個細胞的防禦機制,它在基因調控中發揮著多重作用,包括基因沉默和翻譯的抑制。隨著我們對這一過程的機制有更多的了解,RNA干擾可能會在生物技術和醫學研究上,產生更廣泛的應用。那麼,RNA干擾在未來的基因治療領域又將如何發揮更大的潛力呢?