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病毒的智慧：正鏈RNA病毒如何利用宿主機制進行自我複製？
正鏈RNA病毒（+ssRNA病毒）是一類特殊的病毒，其基因組為正義單鏈RNA，能輕易地被宿主細胞的核糖體翻譯成病毒蛋白。這種類型的病毒包括了多種人類病原體，如丙型肝炎病毒、西尼羅病毒、登革熱病毒以及多種冠狀病毒，如MERS、SARS和SARS-CoV-2等。隨著這些病毒的複製方式的深入研究，科學家們逐步揭示了它們如何利用宿主細胞的內部機制進行自我複製和逃避宿主的免疫反應。
正鏈RNA病毒的基因組通常包含3到10個基因，其中至少包括一個RNA依賴性RNA聚合酶。
正鏈RNA病毒的複製過程
在感染後，正鏈RNA病毒的基因組可以直接作為信使RNA進行翻譯，首先產生的蛋白質會負責基因組的複製，這些蛋白質能夠將正鏈病毒基因組招募到形成的病毒複製複合體中。這些複合體由病毒和宿主細胞的蛋白質組成，並且常與不同細胞器的膜結合，特別是粗糙內質網、粒線體、內質網和高基體等。
正鏈RNA病毒的複製通過雙鏈RNA中間體進行，並可能藉由這些膜狀內陷來避免細胞對於雙鏈RNA的免疫反應。與此同時，在複製過程中，常會產生構建病毒基因組的亞基因組RNA。許多情況下，宿主細胞的翻譯機制可能完全被挪用至生產病毒蛋白，這是因為病毒基因組的內部核糖體進入位點（IRES）元素對核糖體有很高的親和力。
這些病毒不僅利用宿主的翻譯機制，有時還會通過其特有的蛋白酶來破壞細胞mRNA翻譯所需的組分。
病毒的基因重組
在同一宿主細胞中，若存在至少兩個不同的病毒基因組，正鏈RNA病毒可能進行基因重組。這種能力在感染人類的病毒中是相當常見的。研究顯示，RNA重組在病毒的基因組結構及其進化過程中起著重要的推動作用，尤其在Picornaviridae和Retroviridae等家系中。
特別是冠狀病毒，基因重組能使病毒適應宿主環境，進而引起新的傳染病。值得注意的是，這種基因重組的過程有時是因為病毒試圖修復基因組中的損傷而產生的適應性機制。在植物中，诸如阴病毒和肠道病毒等也顯示出強烈的RNA重組現象。
正鏈RNA病毒的分類
在全球的RNA病毒中，正鏈RNA病毒被劃分為三個主要的門：Kitrinoviricota、Lenarviricota和Pisuviricota，這些病毒均隸屬於Orthornavirae王國，並被分為Baltimore分類系統的第四組。
Kitrinoviricota
Kitrinoviricota門主要包含所謂的“阿爾法病毒超群”和“黃病毒超群”。這一門包含多種植物病毒及節肢動物病毒，其下的四個類別中包括了許多與植物和動物相關的病毒。
Lenarviricota
Lenarviricota門則與細菌和真核生物感染的病毒相關聯，這一門的系統發展和演化相對於其他RNA病毒展現出獨特的相似性。
Pisuviricota
Pisuviricota門則被非正式地稱為“腸病毒超群”，它包含了大多數感染動物及植物的eukaryotic病毒，並包含了為數眾多的病毒類別。
正鏈RNA病毒因其在生物體內的複雜交互作用和自我複製機制，引起了科學界的廣泛關注。這些病毒若利用宿主的生理機制而引發新的疾病，未來的研究將如何改變我們對這些病毒的理解及控制策略？
