Jesús Tamariz

Characterisation of the first KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae ST340 from Peru

OBJECTIVES The aim of this study was to characterise a KPC-carrying Klebsiella pneumoniae isolate from a Peruvian hospital setting. METHODS The identity of the isolate was confirmed by amplification and sequencing of the 16S rRNA gene, and the antibiotic resistance profile was determined by disk diffusion and automated methods The sequence type (ST) and phylogenetic group were established by PCR. The presence of different β-lactamase genes was determined, including blaMBL, blaKPC, blaCTX-M, blaSHV, blaOXA-1-like, blaOXA-2-like, blaOXA-5-like, blaOXA-48-like and blaTEM and up to six different plasmid-encoded AmpC genes as well as class 1 integrons. The conjugability of β-lactam resistance was assessed by conjugation. RESULTS The isolate was confirmed to be K. pneumoniae classified as belonging to the KpI phylogenetic group within ST340, which belongs to the high-risk clonal complex 258 (CC258). The isolate was resistant to all β-lactam agents tested, with only the presence of a non-conjugative blaKPC-2 gene being detected and carried in a non-classical genetic structure. CONCLUSIONS This is the first description of a member of CC258 and of a blaKPC-2 gene in Peru. Intensive surveillance is needed to determine the relevance of both in this area.

Comparación de cuatro métodos fenotípicos para la detección de beta-lactamasas de espectro extendido

RESUMEN Objetivo. Comparar la eficacia de cuatro metodos fenotipicos para la identificacion de cepas productoras de β-lactamasas de espectro extendido aisladas de urocultivos. Materiales y metodos. Estudio comparativo de corte transversal. Se analizo 147 cepas aisladas de urocultivos positivos para Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae y Proteus mirabilis entre los meses de enero y febrero de 2009 en el Instituto Nacional de Salud del Nino, las cuales fueron sometidas a una prueba de tamizaje, en aquellas que resultaron positivas se realizo pruebas confirmatorias mediante los cuatro metodos fenotipicos evaluados. Resultados. De las 147 cepas, 43 (29,3%) resultaron sospechosas en las pruebas de tamizaje. Con el metodo descrito por Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) usado como “patron de oro” para el estudio, resultaron 27 positivas (62,8%), resultado similar a lo encontrado con el metodo de Jarlier. Por otro lado, con los metodos de Hodge y el tridimensional, 23 (53,5%) resultaron positivas. La evaluacion de los metodos confirmatorios frente al descrito por CLSI, mostro una sensibilidad y especificidad de 100% para el metodo de Jarlier; en el caso de los metodos de Hodge y metodo tridimensional se encontro una sensibilidad y especificidad de 85,2 % y 100%, respectivamente. Conclusiones. Los metodos evaluados mostraron en todos los casos una alta eficacia, sin presentar diferencias significativas, por lo que podrian utilizarse segun las facilidades del laboratorio clinico involucrado; sin embargo dada las ventajas no tecnicas, como costos, facilidad y factibilidad de su aplicacion, se recomienda el empleo del metodo de Jarlier. Palabras clave: Beta-Lactamasas; Farmacorresistencia microbiana; Tecnicas y procedimientos diagnosticos; Cefalosporinas; Pediatria (fuente: DeCS BIREME).