Paulo Sávio Lopes

Estimativas de parâmetros genéticos para características reprodutivas de suínos

Data on age at first farrowing (IPP), total number of piglets born (NLN), number of piglets born alive (NLNV), and birth litter weight (PLV) were used to estimate genetic and phenotypic parameters of reproductive traits in Large White breed. Genetic and phenotypic variances and covariances were estimated by Restricted Maximum Likelihood method (REML). The model to analyze IPP included direct genetic effect, maternal effect and common litter effect, and the model to analyze NLN, NLNV and PLV included only direct genetic effect. Heritability estimates for direct additive genetic effects ranged from 0.17 to 0.34. Favorable genetic correlations between IPP and the other traits studied were observed. The low heritability estimates for most traits suggest that efficient selection strategies must be sought to increase genetic gain and that response for NLN may be obtained by indirect selection on NLNV.

Avaliação genética de caprinos da raça Alpina utilizando-se a produção de leite no dia do controle

Data consisting of 26,389 individual test day milk yield from 825 lactations of 356 Parda Alpina goats, recorded from 1997 to 2004, were used to estimate genetic parameters and to predict breeding values for test day (PLDC) and accumulated (PAC) milk yields. The model for PLDC included the fixed effects of contemporary group (year-month of test), age of dam at kidding as covariate, and additive genetic, permanent environment and residual random effects. The model for PAC included the same random effects used for PLDC and the fixed effects of contemporary group (year-month of kidding) and the covariates age of dam at kidding and lactation length. Larger heritability estimates for milk yield in the intermediary test days indicate possibility of selection response. Rank correlation between breeding values for milk yield up to 305 days and intermediary PLDC were larger than those on early and late lactation. Despite the high rank correlation, changes in ranking of bucks for milk yield up to 305 days were observed when selection was based on PLDC at 90 days. Selection based on PLDC and PAC in middle lactation may be used as a selection criterion in substitution for milk yield up to 305 days.

Comparação de modelos de regressão aleatória para estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros

Random regression and Legendre polynomial (LP) of different orders were used for modeling the genetic, permanent environmental and residual variances of test day milk yield in dairy goats. The models included the fixed effects of contemporary group, age of dam at kidding as a covariate and the fixed regression of LP for the average lactation curve and the additive genetic, permanent environmental and residual as random effects. According to the values of the logarithm of the likelihood function, AIC and BIC using higher orders of LP (fifth order for the genetic effect and seventh order for the permanent environmental effect) improved the fitting of the models. The model with four classes of residual variances provided the best fit. The eigenvalues of the (co)variances matrix among the regression coefficients suggested the possibility of reducing the dimension of the models. The estimates of genetic variances and genetic and permanent environmental correlations for test day milk yields obtained from polynomials of higher orders are not biologically expected. The LP of fifth order for the addictive genetic and seventh order for the permanent environmental effects was the best fitted model. However, a LP of fourth order for the addictive genetic and of sixth order for the permanent environmental effects may be considered as a more parsimonious model for the estimation of variances of test day milk yield in dairy goats, by random regression.

Avaliação da introdução de tecnologias no sistema de produção de gado de corte no Pantanal. Desempenho e descarte de matrizes

Performance and age distribution of 1,075 cows were recorded during five years (May 1994 to May 1999) in a herd with an extensive cow-calf system in the Pantanal region. During this period new management technologies were introduced with the objective of modify the traditional system and improve herd production. Cows were identified and after pregnancy checking they were maintained or culled from the herd depending on the overall evaluation of the reproductive performance. Data were modeled using generalized estimating equation (GEE) with logistic function and binomial distribution, which is an extension of generalized linear models (GLIM). The GEE approach takes into account the structure of covariance categorical repeated measurements in the subject for parameter estimates. Cows culling rate was significantly affected by pasture, management, and linear and quadratic cow age. Use of new technologies did not clearly increase the probability of pregnancy. Breeding season increased cows culling rate leading to a greater replacement of cows in the herd.

Modeling the effect of the age of dam at calving on the weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves

Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar alternativas para a modelagem do efeito da idade da vaca ao parto sobre o peso a desmama de bezerros mesticos Charoles-Zebu. Os dados de 56.965 bezerros foram analisados por meio de modelos estatisticos, considerando os efeitos fixos de grupo de contemporâneos, grupos geneticos do touro e da vaca e da idade da vaca ao parto. O efeito da idade da vaca ao parto foi modelado utilizando-se classes anuais de idade, polinomios ordinarios (PO) de ordem quadratica ate quintica, ou polinomios segmentados com 2, 3, 4, 6 ou 12 intervalos do mesmo tamanho. No caso dos polinomios segmentados, consideraram-se os efeitos linear e quadratico gerais e apenas o quadratico a partir de cada no. Os efeitos da idade da vaca ao parto foram considerados aninhados em sexo do bezerro em todos os casos. De acordo com os criterios de ajuste utilizados, ou seja, o teste F para diferencas de soma de quadrados, coeficiente de determinacao do modelo, soma de quadrados do residuo e media dos residuos ao quadrado, o polinomio segmentado com tres intervalos (dois nos) se ajustou tao bem aos dados quanto os polinomios mais complexos.

Estimativas de parâmetros genéticos para características de desempenho de suínos em fase de crescimento e terminação

Foram utilizados dados de conversao alimentar, espessura de toucinho corrigida para 100kg, idade para atingir 100kg e ganho de peso medio diario, para estimar parâmetros geneticos e fenotipicos de caracteristicas de desempenho de suinos da raca Large White. As caracteristicas estudadas foram avaliadas por sexo, em razao do manejo diferenciado para machos e femeas. Variâncias e covariâncias geneticas e fenotipicas foram estimadas pelo metodo da maxima verossimilhanca restrita, usando modelo que incluiu os efeitos geneticos direto, materno e comum de leitegada. As estimativas de herdabilidade do efeito genetico direto variaram de 0,13 a 0,55, indicando que, para a maioria das caracteristicas, o uso da selecao direta deve ser eficiente. Os valores das estimativas de herdabilidade do efeito genetico materno foram baixos (0,02 a 0,05). As estimativas do efeito comum de leitegada variaram de baixas a medias (0,05 a 0,18). As correlacoes geneticas entre as caracteristicas indicaram que, quando o objetivo do programa de melhoramento e a melhoria de todas as caracteristicas, deve-se fazer selecao direta para conversao alimentar, espessura de toucinho e idade para atingir 100kg de peso vivo, e indireta para ganho de peso medio diario por meio da selecao da idade para atingir 100kg.

Ratios between variability components of simulated quantitative traits with genetic effects of dominance and overdominance

Ratios were assessed between variability components of quantitative traits simulated from the genome incorporating non-additive genetic effects in random mating populations and short-term phenotypic selection. A trait of low (h2 = 0.10) heritability and another of high (h2 = 0.60) heritability were studied, both influenced by 600 bi-allelic loci. Five gene action models were simulated, of which four included complete and positive dominance for 25, 50, 75 and 100% of the loci (D25, D50, D75 and D100, respectively); and one model included positive overdominance for 50% of the loci. Every model included additive effects of the alleles for 100% of the loci. The main quantified ratios were d2 (dominance variance/phenotypic variance) and d2a (dominance variance/additive variance). For both traits, d2 and d2a increased according to the increase in the variance of dominance with the growing inclusion of loci with dominance deviation and under overdominance. For the same model, both ratios, especially d2, are greater under high heritability, that indicates that the dominance effects explain the greater part of the total variability of this trait under selection.

Sire X Herd and Sire X Herd-Year Interactions on Genetic Evaluation of Buffaloes

The USA was the largest cows milk producer in the world in 2010 accounting for 14.6% of world production. World cows milk production in 2010 stood at nearly 600 million tonnes, with the top ten producing countries accounting for 55.7% of production. The USA is the largest cows milk producer in the world accounting for 14.6% of world production, producing over 87 million tonnes in 2010, an increase of 1.8% when compared to 2009 (DAIRYCO, 2012).

Heterogeneidade de Variância da Avaliação Genética de Bovinos da Raça Tabapuã em Análises com Efeitos Maternos

Com dados usados na avaliacao genetica da raca Tabapua, verificou-se influencia da heterogeneidade de variâncias sobre parâmetros geneticos e valores geneticos dos reprodutores, sendo esta estudada dividindo-se os dados, com base no desvio-padrao fenotipico dos grupos de contemporâneos, do peso aos 120 dias, nas classes: baixo ( 18,9 kg) desvios-padrao, realizacao de analises de caracteristicas multiplas, com efeitos maternos no modelo nas quais o peso, em cada classe, foi tratado como caracteristica distinta. Usando-se teste da razao de verossimilhanca constatou-se importância do efeito materno nos pesos aos 120 e 240 dias. A heterogeneidade de variâncias genetica e residual mostrou-se importante, implicando em maiores valores de herdabilidades para os pesos nas classes de maior desvio-padrao. Os valores geneticos preditos em analise geral (sem classes) correlacionaram-se, em maior intensidade, com valores dos pesos na classe de alto desvio-padrao, das analises de multiplas caracteristicas.

Influência da Heterogeneidade de Variância no Ordenamento de Reprodutores da Raça Tabapuã

Com dados da raca Tabapua, verificou-se a influencia da heterogeneidade de variâncias no ordenamento de valores geneticos dos reprodutores. Pesos ajustados aos 120, 240 e 420 dias de idade foram estratificados pelo desvio-padrao fenotipico dos grupos de contemporâneos, com peso aos 120 dias, em tres classes: baixo ( 18,9 kg) desvios-padrao. Calcularam-se correlacoes de Pearson e de Spearman entre valores geneticos dos reprodutores obtidos em analise de caracteristica unica geral e em analises de caracteristicas multiplas, com o peso, em cada classe de desvio-padrao, considerado como diferentes caracteristicas. Selecionando-se 10% dos melhores reprodutores, observou-se maior percentual de touros em comum, classificados por analise de caracteristica unica geral, quando comparados aos classificados na classe de alto desvio-padrao e menor na classe de baixo desvio-padrao, das analises de caracteristicas multiplas, mostrando alteracao na escolha dos melhores animais se existe a heterogeneidade de variância.