Xu Zhiwen

猪伪狂犬病毒 Fa 株侵染对 PK-15 细 microRNA s 表达谱的影响

目的分析猪伪狂犬病毒Fa株(PRV-Fa)侵染对猪肾传代细胞PK-15 microRNAs (miRNAs)表达谱的影响。 方法利用Illumina高通量测序技术，鉴定感染和非感染PRV-Fa的PK-15细胞的miRNAs；筛选并利用实时荧光定量RT-PCR (RT-qPCR)验证差异表达miRNAs；对差异miRNAs进行靶基因预测和Gene ontology (GO)分析。 结果在感染和未感染PK-15细胞中分别检测到384个和405个miRNAs，其中感染PRV-Fa后差异表达的miRNAs共127个(60个上调，67个下调)。荧光定量结果显示差异miRNAs的表达趋势与高通量测序结果一 致。GO分析显示，miRNAs广泛参与信号传导、细胞代谢、免疫反应、基因表达等生物学进程，其中miR-10b、miR-16、miR-18a、miR-19b、miR-20a、miR-145-5p、miR-146a、miR-181a、miR-499-5p等miRNAs与免疫相关。在靶基因调控网络图中，ssc-miR-30a-5p与ssc-miR-30d处于关键位置。研究鉴定出5个新的病毒编码miRNAs，其中PRV-miR-LLT2与PRV-miR-LLT4靶向PRV早期蛋白基因EPO。 结论伪狂犬病毒Fa株感染对PK-15细胞编码miRNAs有显著影响。