在基因组学中,无义突变(nonsense mutation)是一种点突变,这种突变改变了DNA序列,导致生成无义密码子(nonsense codon),即在转录的mRNA中出现早期终止的情况。这通常会导致产生不完全、截断的蛋白质,甚至可能是非功能的蛋白质。尽管无义突变的影响通常被认为是负面的,但实际上它们不一定都对生物体有害。
无义突变的功能性影响取决于多个方面,包括终止密码子在编码DNA中的位置。
例如,无义突变的影响可能取决于该突变与原有终止密码子的距离,以及对功能性子域的影响程度。由于无义突变导致多肽链的过早终止,因此也被称为链终止突变。这些突变的影响范围不一,且对不同基因和组织的影响率各异,大约有10%的面临遗传疾病的患者与无义突变有关。
在多数情况下,无义突变会导致有害的结果,这是最常见的自然现象。有害的无义突变会降低生物的整体适应性及生殖成功率。例如,发生在编码某一特定蛋白质的基因上的无义突变,可能会导致蛋白质的结构或功能缺陷,这对该生物的生存可能会产生重大影响。
中性无义突变则不会对生物造成任何益处或损害。在这种情况下,突变的效果并不明显,意味着这种变化不会对生物造成正面或负面的影响。一些突变可能发生在接近原有终止密码子的地方,因此它们的影响可能并不明显。这么说来,这种情况相对少见。
有益的无义突变被认为是最罕见的突变结果。这类突变反而会提高生物的整体适应性及生殖成功率。尽管无义突变引入的早期终止密码子通常会导致损害,但在某些情况下,这种突变可能会中断某些不正常或有毒的蛋白质的生成,从而提高生物的生存率。
为了抑制无义突变产生的负面影响,许多生物体,包括人类,都会使用无义介导的mRNA衰减(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)途径。这种机制会在蛋白质合成前降解包含无义突变的mRNA,从而避免产生不功能的多肽。
一些生物还可以通过改变tRNA来抑制无义突变的损害,这种类型的tRNA被称为抑制tRNA。
无义突变约占人类疾病相关单核苷酸替换的20%。这些突变的病理往往是因为完整蛋白质的数量减少,因为只有5-25%的含有无义突变的转录物不会经历衰减过程。
针对无义突变导致的疾病,治疗策略旨在恢复正常功能,通过降低NMD的效率,促进翻译过程中对早期终止密码子的忽略,或者直接编辑基因组中的无义突变。最近的研究已经探索了抑制NMD的抗反义寡核苷酸,并且一些合成的抑制tRNA被用作潜在的治疗手段。
如同 Ataluren 这类药物,有助于选择性地读取异常的终止密码子,让其成为治疗无义突变相关疾病的潜在选择。
总之,无义突变在基因组中扮演着重要角色,从疾病的产生到治疗的探索,无义突变的影响深远而复杂。那么,在未来的基因治疗中,我们是否能找到更具有效性的方法来对抗这些影响?