在遗传生物学中,释放因子(release factors)扮演着至关重要的角色,尤其是在蛋白质合成的最后阶段。这些特殊的蛋白质能够识别信使RNA(mRNA)中的终止密码子,从而促进翻译的终止。这一过程的了解不仅揭示了细胞内部运作的奥秘,还为科学家开启了研究更复杂生命现象的新窗口。
「释放因子的存在让新合成的多肽能够顺利从核糖体中释放出来,否则它们将无法完成制造。」
在mRNA的翻译过程中,大多数密码子是由被称为氨基酸转运RNA(aminoacyl-tRNAs)的“充电”tRNA分子所识别。根据标准的遗传密码,mRNA中有三种终止密码子:UAG(“琥珀”)、UAA(“黄土”)和UGA(“蛋白”或“环境”)。尽管这些终止密码子看似与普通密码子无异,但它们却并不被tRNA翻译。 1967年,科学家马里奥·卡佩基(Mario Capecchi)首次提出,所谓的释放因子并非tRNA,而是一种蛋白质。
释放因子分为两大类。第一类释放因子通过在核糖体的A位点结合,模拟tRNA的结合方式来识别终止密码子,并在聚肽释放时解体核糖体。第二类释放因子则是GTP酶,负责增强第一类释放因子的活性,帮助其从核糖体中解离。细菌释放因子包括RF1、RF2和RF3等。而在真核生物和古生物中,这些释放因子的命名相应改为“eRF”,表达“真核释放因子”的意思。
「释放因子的演化显示出细菌及古生物-真核生物的释放因子之间的分开发展,反映了生命演化的异彩纷呈。」
在结构与功能方面,科学家们已经解开了多种细菌70S核糖体与三种释放因子的晶体结构,显示了RF1和RF2在终止密码子识别中的细节。此外,真核生物的80S核糖体在与eRF1和eRF3结合时的冷EM结构也提供了进一步的洞见。这些结构帮助我们理解在终止过程中,即使是微小的变化也可能影响整个翻译机制。
对于细菌的释放因子而言,它们主要由四个域组成。其中,每一个域都有其特定的催化性质和功能。特别是第二域中的“三肽反密码子”结构,对终止密码子的识别至关重要。该构造只有一个残基通过氢键的形式参与此次过程,而第三域中的GGQ动机则对于肽基-tRNA水解酶(PTH)活性至关重要。
在真核生物类似的结构中,eRF1被分为四个域,N端域主要负责终止密码子的识别,以及M域和C域在聚肽释放过程中的功能。释放因子的协同作用对于RNA合成的完整性至关重要。在这一系统中,当eRF3水解GTP后,放置位置的变化使GGQ进入肽转移中心(PTC)以促进水解。
「透过释放因子的作用,核糖体不仅能够有效地释放合成的蛋白质,还能够准备再次参与后续的翻译过程。」
科技的进步,使我们得以窥见这些复杂的生物过程,并对它们进行更加深入的理解。而且,有关释放因子的研究不仅对分子生物学领域具有深远影响,也可能为医学领域的应用带来新的可能性,尤其是在开发新疗法和药物方面。
释放因子的进一步研究如何能够帮助我们揭开更多生命奥秘的大门?