在基因組學中,無義突變(nonsense mutation)是一種點突變,這種突變改變了DNA序列,導致生成無義密碼子(nonsense codon),即在轉錄的mRNA中出現早期終止的情況。這通常會導致產生不完全、截斷的蛋白質,甚至可能是非功能的蛋白質。儘管無義突變的影響通常被認為是負面的,但實際上它們不一定都對生物體有害。
無義突變的功能性影響取決於多個方面,包括終止密碼子在編碼DNA中的位置。
例如,無義突變的影響可能取決於該突變與原有終止密碼子的距離,以及對功能性子域的影響程度。由於無義突變導致多肽鏈的過早終止,因此也被稱為链终止突变。這些突變的影響範圍不一,且對不同基因和組織的影響率各異,大約有10%的面臨遺傳疾病的患者與無義突變有關。
在多數情況下,無義突變會導致有害的結果,這是最常見的自然現象。有害的無義突變會降低生物的整體適應性及生殖成功率。例如,發生在編碼某一特定蛋白質的基因上的無義突變,可能會導致蛋白質的結構或功能缺陷,這對該生物的生存可能會產生重大影響。
中性無義突變則不會對生物造成任何益處或損害。在這種情況下,突變的效果並不明顯,意味著這種變化不會對生物造成正面或負面的影響。一些突變可能發生在接近原有終止密碼子的地方,因此它們的影響可能並不明顯。這麼說來,這種情況相對少見。
有益的無義突變被認為是最罕見的突變結果。這類突變反而會提高生物的整體適應性及生殖成功率。儘管無義突變引入的早期終止密碼子通常會導致損害,但在某些情況下,這種突變可能會中斷某些不正常或有毒的蛋白質的生成,從而提高生物的生存率。
為了抑制無義突變產生的負面影響,許多生物體,包括人類,都會使用無義介導的mRNA衰減(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)途徑。這種機制會在蛋白質合成前降解包含無義突變的mRNA,從而避免產生不功能的多肽。
一些生物還可以通過改變tRNA來抑制無義突變的損害,這種類型的tRNA被稱為抑制tRNA。
無義突變約占人類疾病相關單核苷酸替換的20%。這些突變的病理往往是因為完整蛋白質的數量減少,因為只有5-25%的含有無義突變的轉錄物不會經歷衰減過程。
針對無義突變導致的疾病,治療策略旨在恢復正常功能,通過降低NMD的效率,促進翻譯過程中對早期終止密碼子的忽略,或者直接編輯基因組中的無義突變。最近的研究已經探索了抑制NMD的抗反義寡核苷酸,並且一些合成的抑制tRNA被用作潛在的治療手段。
如同 Ataluren 這類藥物,有助於選擇性地讀取異常的終止密碼子,讓其成為治療無義突變相關疾病的潛在選擇。
無義突變在基因組中扮演著重要角色,從疾病的產生到治療的探索,無義突變的影響深遠而複雜。那麼,在未來的基因治療中,我們是否能找到更具有效性的方法來對抗這些影響?