在細胞內部,蛋白質扮演著多重角色,而這些角色的實現往往受到各種修飾的調控。NEDDylation是一種重要的蛋白質修飾過程,與另一種更為人知的修飾過程—泛素化(ubiquitination)相似,影響著細胞的生命週期以及功能運作。NEDD8是一種在人體中由NEDD8基因編碼的類泛素蛋白,該蛋白在小鼠酵母中的對應名稱為Rub1。NEDD8的功能與其修飾過程密切相關,這一過程不僅影響蛋白質的命運,還與細胞週期、DNA修復及癌症等生物學現象密切相連。
NEDD8變為共價結合形式後,能夠影響特定蛋白質的活性,其調控能力在一定程度上改變了這些蛋白質的命運。
NEDDylation的過程如同泛素化,由NEDD8的激活開始。NEDD8需要經過特定的酶進行激活,該過程由由APPBP1和UBA3組成的NEDD8激活E1酶來實現。在此過程中,UBA3通過ATP依賴的反應活化NEDD8,形成高能的硫酯中間體。在NEDD8被激活後,它會被轉移至UbcH12 E2酶,最終在適當的E3酶存在下與特定底物結合。
根據Brown等人的評價,NEDD8的最著名底物是cullin蛋白(如CUL1和CUL2等),這些蛋白負責作為cullin-RING泛素連接酶(CRLs)的分子支架。NEDDylation將NEDD8的結構共價結合到cullin的某個保守賴氨酸殘基上,這一過程促進了CRL的泛素化活性,隨之帶來語義上的結構變化,並且優化了泛素向目標蛋白的轉移。
NEDD8的去除主要由若干不同的蛋白酶組成,比如UCHL1、UCHL3和USP21等這些對NEDD8和泛素有雙重特異性的蛋白酶。另外,專一性的NEDD8去除酶有COP9信號複合體,它們能夠去除來自cullin的NEDD8,以及NEDP1(又名DEN1、SENP8)等酶。
當DNA受損,NEDD8的積累會在損傷部位進行動態的變化。在DNA堆積修復中的NEDDylation過程,是全球基因組修復(GGR)的一個子路徑。在這個過程中,因UV輻射造成的DNA損傷後,Cul4A的激活對於GGR-NER的進行至關重要。此外,NEDD8在雙鏈斷裂的修復中也有重要角色,尤其在用於修復雙鏈斷裂的非同源末端接合(NHEJ)路徑中。
在NHEJ的過程中,Ku70/Ku80異聚體的形成是第一步的關鍵,但這些異聚體必須在修復後被去除,否則將阻礙轉錄和複製的進行。
研究指出,通過對DNA損傷修復基因的過度甲基化,可能會成為癌症進展的早期步驟。NEDD8的激活在DNA修復途徑(如NER與NHEJ)中扮演著重要的角色。若NEDD8的激活被抑制,則DNA修復能力不足將導致細胞死亡,這對癌細胞的影響可能比分別的正常細胞更為顯著。相關研究顯示,抗腫瘤藥物Pevonedistat(MLN4924)能顯著提高癌症治療的療效,在多個臨床試驗中顯示出樂觀的結果。
NEDD8的激活與PPARγ的相互作用在脂肪生成和脂質積累中起著至關重要的作用。通過施用Pevonedistat,在小鼠實驗中顯示可預防高脂飲食引起的肥胖和葡萄糖不耐受。此外,NEDD8還被發現會抑制NF-κB的轉運,利用相同藥物來針對不同癌症類型的臨床研究也在積極進行中。
無論是在細胞功能的調節還是癌症治療中的潛力,NEDD8及其修飾途徑都顯示出多樣的應用可能性。未來的研究是否能揭開這個過程的更多奧秘,從而帶來全新的治療方法呢?