Language
Country/Area
No result found
Pourquoi les mNGS sont-ils un super-héros lors du diagnostic des infections ?
Avec les progrès de la technologie, les méthodes traditionnelles de diagnostic des agents pathogènes sont confrontées à des défis sans précédent. Le séquençage génomique métabolique clinique de nouvelle génération (mNGS) a progressivement montré ses avantages uniques, notamment dans le diagnostic de maladies infectieuses complexes. Ses capacités de détection complètes en font un outil aussi important qu'un super-héros.
Le séquençage de nouvelle génération de la génomique métabolique clinique offre la possibilité d’une détection complète des agents pathogènes potentiels, ce qui est particulièrement précieux lorsque les méthodes traditionnelles sont difficiles à utiliser.
Qu'est-ce que le mNGS ?
Le mNGS fait référence à l’analyse du matériel génétique (ADN ou ARN) des micro-organismes et des hôtes dans des échantillons cliniques grâce à une technologie de séquençage de nouvelle génération sans qu’il soit nécessaire de connaître le pathogène spécifique. L’un des principaux avantages de cette approche est sa capacité à détecter plusieurs agents pathogènes simultanément, en particulier lorsque d’autres méthodes de détection plus ciblées (telles que la PCR) échouent.
Flux de travail en laboratoire
Le flux de travail typique du mNGS comprend la collecte d'échantillons, l'extraction d'ARN/ADN, la préparation des stocks, le séquençage à haut débit et l'analyse bioinformatique. La qualité du prélèvement d’échantillons affecte directement les résultats du test, il doit donc être effectué avec prudence.
Collecte et extraction d'échantillons
Les sources d’échantillons les plus couramment utilisées comprennent le sang, les selles, le liquide céphalo-rachidien (LCR), l’urine et les écouvillons nasopharyngés. Lors de l’extraction d’échantillons, choisissez le kit d’extraction approprié pour exclure les interférences de fond et vous concentrer sur l’ARN ou l’ADN du pathogène.
Préparation des stocks et séquençage à haut débit
En raison de l’influence du bruit de fond, les stratégies visant à augmenter les signaux pathogènes sont particulièrement importantes. Le choix de la plateforme de séquençage à haut débit dépend des objectifs de recherche et de l'expérience du laboratoire. Actuellement, le système Illumina MiSeq est le choix le plus courant, mais des technologies émergentes telles que MinION présentent également un grand potentiel.
L’amélioration de la technologie de séquençage à haut débit a rendu la surveillance urgente et les applications épidémiologiques de diverses causes inconnues plus immédiates et plus précises.
Applications du mNGS
Le mNGS présente un potentiel significatif dans le diagnostic des maladies infectieuses, en particulier pour les agents pathogènes qui ne peuvent pas être localisés par les méthodes de détection traditionnelles. Par exemple, le mNGS surpasse les tests microbiologiques traditionnels dans le diagnostic de la méningite et de l’encéphalite.
Étude de la résistance aux antibiotiques
Alors que la résistance aux antibiotiques devient un problème croissant, le mNGS offre une nouvelle façon de détecter et de caractériser ces gènes, aidant la communauté médicale à mieux comprendre et relever ce défi.
Défis et perspectives d'avenir
Bien que le mNGS ait des applications dans de nombreux domaines, des défis tels que son utilité clinique, sa validité en laboratoire et son aspect économique doivent encore être relevés. De nombreuses études en sont encore au stade de rapport de cas et manquent d’application clinique à grande échelle.
ConclusionÀ l’avenir, si les défis actuels peuvent être surmontés, le mNGS démontrera sa valeur indispensable en matière de santé publique et de prévention et de contrôle des épidémies.
La demande d’outils de diagnostic rapide continuant d’augmenter, le mNGS deviendra-t-il une pratique plus courante et standard dans le diagnostic des maladies infectieuses à l’avenir ?
