기술의 빠른 발전으로 임상 메타 게놈 차세대 시퀀싱 (MNG)은 전염병 진단을위한 강력한 도구가되었습니다. 이 기술은 특정 병원체를 알지 못하고 미생물 및 임상 샘플의 숙주에 대한 유전 물질의 포괄적 인 분석을 허용합니다. 그러나 샘플링 프로세스 중이 기술의 정확성을 보장하는 방법은 여전히 중요한 과제입니다.
전통적인 병원체 검출 방법은 종종 샘플 처리 및 배경 노이즈에 의해 방해되며 MNG는 동시에 여러 병원체를 감지 할 수 있으며 이는 가장 큰 이점입니다.
MNG의 정확도는 먼저 올바른 샘플 수집에 따라 다릅니다. 일반적으로, 혈액, 뇌척수액, 소변 및 비 인두 면봉은 가장 일반적으로 사용되는 샘플입니다. 이 샘플은 특히 요추 천자와 같은 외상성 절차를 수행 할 때 교차 오염을 피해야합니다. 샘플의 청결은 후속 시퀀싱의 정확도에 직접적인 영향을 미치므로 멸균 환경에서 샘플링을 수행해야합니다.
핵산 추출의추출 과정에서 올바른 추출 키트를 선택하는 것이 중요합니다. 예를 들어, 높은 환경 노이즈를 갖는 샘플에 대한 특정 RNA 또는 DNA 추출 방법을 선택하면 병원체 검출의 특이성과 편의성을 향상시킬 수 있습니다. 추출 공정은 샘플의 병원체 RNA/DNA를 효과적으로 추출 할 수 있고 배경 노이즈의 영향을 최소화해야합니다.
음성 선택 또는 양성 강화와 같은 표적화 된 농축 방법을 사용하면 샘플에서 병원체 신호의 검출 속도가 향상 될 수 있습니다.
시퀀싱 단계에서 올바른 시퀀싱 플랫폼을 선택하는 것도 결과의 정확성에 중요합니다. 일반적으로 Illumina Miseq 시스템은 전염병 연구에서 널리 퍼져있는 선호되는 플랫폼이며 빠르게 운영되며 강력한 커뮤니티 지원을받습니다. 기술이 개선되면서 미니언과 같은 다른 플랫폼은 점차 자원이 제한된 소규모 실험실의 잠재적 옵션이되고 있습니다.
시퀀싱 데이터 분석에는 결과의 정확도를 향상시키기 위해 데이터 청소, 전단 및 중복 제거를 포함한 전문 생물 정보학 지식이 필요합니다. 배경 노이즈를 줄이기 위해 숙주 게놈에서 읽기를 제거하는 것이이 과정에서 중요한 단계입니다. 또한 분석 결과를 공개 데이터베이스와 비교하여 조직 범위를 식별하여 후속 결과의 신뢰성을 보장합니다.
현재 MNG의 구현은 임상 실용성, 실험실 효과 및 비용과 같은 많은 임상 문제에 직면 해 있습니다. 따라서 이러한 프로세스 및 기술의 지속적인 개선은 MNGS 탐지의 정확성을 보장하는 데 중요한 부분입니다. 대상 모니터링 및 참조 표준 설립은 의료 분야에서 효과적인 응용 프로그램을 촉진 할 수 있습니다.
전통적인 미생물 테스트와 MNGS 기술을 결합하면 특히 복잡한 감염을 모니터링 할 때 진단 민감도와 정확성을 향상시킬 수 있습니다.
MNG의 미래 개발은 기술 진보에 달려있을뿐만 아니라 의료계의 광범위한 수용 및 임상 검증이 필요합니다. 적용 범위가 확장됨에 따라 더 많은 사례가 전염병 진단에서의 가치를 보여줍니다. 우리는이 기술로 인한 혁명적 변화에 대비할 준비가 되었습니까?