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Featured researches published by Carmen Rubio.


Antimicrobial Agents and Chemotherapy | 2011

Prospective Multicenter Study of the Epidemiology, Molecular Identification, and Antifungal Susceptibility of Candida parapsilosis, Candida orthopsilosis, and Candida metapsilosis Isolated from Patients with Candidemia

Emilia Cantón; Javier Pemán; Guillermo Quindós; Elena Eraso; Ilargi Miranda-Zapico; Alvarez M; Paloma Merino; Isolina Campos-Herrero; Francesc Marco; Elia Gomez G. de la Pedrosa; Genoveva Yagüe; Remedios Guna; Carmen Rubio; Consuelo Miranda; Carmen Pazos; David Velasco

ABSTRACT A 13-month prospective multicenter study including 44 hospitals was carried out to evaluate the epidemiology of Candida parapsilosis complex candidemia in Spain. Susceptibility to amphotericin B, flucytosine, fluconazole, itraconazole, voriconazole, posaconazole, anidulafungin, caspofungin, and micafungin was tested by the microdilution colorimetric method. A total of 364 C. parapsilosis complex isolates were identified by molecular methods: C. parapsilosis (90.7%), Candida orthopsilosis (8.2%), and Candida metapsilosis (1.1%). Most candidemias (C. parapsilosis, 76.4%; C. orthopsilosis, 70.0%; C. metapsilosis, 100%) were observed in adults. No C. orthopsilosis or C. metapsilosis candidemias occurred in neonates. C. parapsilosis was most frequent in adult intensive care unit (28.8%), surgery (20.9%), and internal medicine (19.7%) departments; and C. orthopsilosis was most frequent in hematology (28.6%), pediatrics (12.0%), and neonatology (11.5%) departments. The geographic distribution of C. orthopsilosis and C. metapsilosis was not uniform. According to CLSI clinical breakpoints, all C. orthopsilosis and C. metapsilosis isolates were susceptible to the nine agents tested. Resistance (MICs > 1 mg/liter) was observed only in C. parapsilosis: amphotericin B, posaconazole, itraconazole, and caspofungin (0.3% each), anidulafungin (1.9%), and micafungin (2.5%). Applying the new species-specific fluconazole and echinocandin breakpoints, the rates of resistance to fluconazole for C. parapsilosis and C. orthopsilosis increased to 4.8% and 0.3%, respectively; conversely, for C. parapsilosis they shifted from 1.9 to 0.6% (anidulafungin) and from 2.5 to 0.6% (micafungin). Our study confirms the different prevalence of C. parapsilosis complex candidemia among age groups: neither C. orthopsilosis nor C. metapsilosis was isolated from neonates; interestingly, C. metapsilosis was isolated only from adults and the elderly. The disparity in antifungal susceptibility among species could be important for therapy.


Antimicrobial Agents and Chemotherapy | 2001

Bacteriocin Production in Vancomycin-Resistant and Vancomycin-Susceptible Enterococcus Isolates of Different Origins

Rosa del Campo; Carmen Tenorio; Rufino Jiménez-Díaz; Carmen Rubio; Rafael Gómez-Lus; Fernando Baquero; Carmen Torres

ABSTRACT Bacteriocin production was determined for 218Enterococcus isolates (Enterococcus faecalis[93] and E. faecium[125]) obtained from different origins (human clinical samples [87], human fecal samples [78], sewage [28], and chicken samples [25]) and showing different vancomycin susceptibility patterns (vancomycin resistant, all of them vanA positive [56], and vancomycin susceptible [162]). All enterococcal isolates were randomly selected except for the vancomycin-resistant ones. A total of 33 isolates of eight different bacterial genera were used as indicators for bacteriocin production. Forty-seven percent of the analyzed enterococcal isolates were bacteriocin producers (80.6% of E. faecalis and 21.6% ofE. faecium isolates). The percentage of bacteriocin producers was higher among human clinical isolates (63.2%, 81.8% of vancomycin-resistant isolates and 60.5% of vancomycin-susceptible ones) than among isolates from the other origins (28 to 39.3%). Only one out of the 15 vancomycin-resistant isolates from human fecal samples was a bacteriocin producer, while 44.4% of fecal vancomycin-susceptible isolates were. The bacteriocin produced by the vanA-containing E. faecium strain RC714, named bacteriocin RC714, was further characterized. This bacteriocin activity was cotransferred together with thevanA genetic determinant to E. faecalis strain JH2-2. Bacteriocin RC714 was purified to homogeneity and its primary structure was determined by amino acid sequencing, showing an identity of 88% and a similarity of 92% with the previously described bacteriocin 31 from E. faecalis YI717. The presence of five different amino acids in bacteriocin RC714 suggest that this could be a new bacteriocin. The results obtained suggest that the epidemiology of vancomycin resistance may be influenced by different factors, including bacteriocin production.


Mycopathologia | 2002

Isolation of Malassezia globosa and M. sympodialis from patients with pityriasis versicolor in Spain

Carmen Aspiroz; Mariano Ara; Marzo Varea; Antonio Rezusta; Carmen Rubio

Pityriasis versicolor is a superficial infection of the stratum corneum by several yeast species formerly collectively named Malassezia furfur. The genus Malassezia has been recently enlarged with new species. With the exception of M. pachydermatis, the remaining six species have an absolute requirement in vitro for supplementation of long-chain fatty acids in media. These lipophilic yeasts comprise six species: M. furfur, M. globosa, M. obtusa, M. restricta, M. slooffiae and M. sympodialis. The aim of this study was to establish whether there was any association between the various species of Malassezia and pityriasis versicolor lesions. Thus, we studied the isolates from 79 patients with pityriasis versicolor, both from lesions and from apparently healthy skin close to the visible lesions. In pityriasis versicolor lesions, the species most frequently isolated was M. globosa (90%), followed by M. sympodialis (41%). Almost all isolates (99%) belonged to one of these two species. The most frequent pattern was M. globosa as the sole species (58% of cases), although the association with M. sympodialis was also frequent (30%). These results confirmed M. globosa as the main agent of pityriasis versicolor and M. sympodialis as the second agent in importance. Malassezia globosa was found to be a species with high levels of esterase and lipase enzymes of probable importance in their pathogenicity.


Journal of Clinical Microbiology | 2013

Epidemiological Cutoff Values for Fluconazole, Itraconazole, Posaconazole, and Voriconazole for Six Candida Species as Determined by the Colorimetric Sensititre YeastOne Method

Emilia Cantón; Javier Pemán; Carmen Iñiguez; David Hervás; José Luis López-Hontangas; Cidália Pina-Vaz; Juan J. Camarena; Isolina Campos-Herrero; Inmaculada García-García; Ana María García-Tapia; Remedios Guna; Paloma Merino; Luisa Pérez del Molino; Carmen Rubio; Anabel Suárez

ABSTRACT In the absence of clinical breakpoints (CBP), epidemiological cutoff values (ECVs) are useful to separate wild-type (WT) isolates (without mechanisms of resistance) from non-WT isolates (those that can harbor some resistance mechanisms), which is the goal of susceptibility tests. Sensititre YeastOne (SYO) is a widely used method to determine susceptibility of Candida spp. to antifungal agents. The CLSI CBP have been established, but not for the SYO method. The ECVs for four azoles, obtained using MIC distributions determined by the SYO method, were calculated via five methods (three statistical methods and based on the MIC50 and modal MIC). Respectively, the median ECVs (in mg/liter) of the five methods for fluconazole, itraconazole, posaconazole, and voriconazole (in parentheses: the percentage of isolates inhibited by MICs equal to or less than the ECVs; the number of isolates tested) were as follows: 2 (94.4%; 944), 0.5 (96.7%; 942), 0.25 (97.6%; 673), and 0.06 (96.7%; 849) for Candida albicans; 4 (86.1%; 642), 0.5 (99.4%; 642), 0.12 (93.9%; 392), and 0.06 (86.9%; 559) for C. parapsilosis; 8 (94.9%; 175), 1 (93.7%; 175), 2 (93.6%; 125), and 0.25 (90.4%; 167) for C. tropicalis; 128 (98.6%; 212), 4 (95.8%; 212), 4 (96.0%; 173), and 2 (98.5; 205) for C. glabrata; 256 (100%; 53), 1 (98.1%; 53), 1 (100%; 33), and 1 (97.9%; 48) for C. krusei; 4 (89.2%; 93), 0.5 (100%; 93), 0.25 (100%; 33), and 0.06 (87.7%; 73) for C. orthopsilosis. All methods included ≥94% of isolates and yielded similar ECVs (within 1 dilution). These ECVs would be suitable for monitoring emergence of isolates with reduced susceptibility by using the SYO method.


Antimicrobial Agents and Chemotherapy | 2005

Streptococcus pyogenes Pharyngeal Isolates with Reduced Susceptibility to Ciprofloxacin in Spain: Mechanisms of Resistance and Clonal Diversity

Sebastián Albertí; Guadalupe Cortés; César García-Rey; Carmen Rubio; Fernando Baquero; J. A. García-Rodríguez; Emilio Bouza; Lorenzo Aguilar

ABSTRACT A survey of emm gene sequences and an analysis of the pulsed-field electrophoretic profiles of 30 Streptococcus pyogenes isolates with reduced susceptibilities to ciprofloxacin detected the prevalence of isolates with emm type 6 and considerable genetic diversity among isolates. The mechanism of ciprofloxacin resistance in these isolates was based on point mutations in topoisomerase IV subunit C encoded by parC, mainly replacement of serine-79 by alanine.


Antimicrobial Agents and Chemotherapy | 2005

Sensititre YeastOne Caspofungin Susceptibility Testing of Candida Clinical Isolates: Correlation with Results of NCCLS M27-A2 Multicenter Study

Emilia Cantón; Javier Pemán; Miguel Gobernado; Elena Álvarez; Fernando Baquero; Ramón Cisterna; Joaquina Gil; Estrella Martín-Mazuelos; Carmen Rubio; Aurora Sanchez-Sousa; Carmen Serrano

ABSTRACT The ability of Sensititre YeastOne to discriminate isolates with reduced caspofungin susceptibility was determined against 36 Candida spp. (6 with a known FKS1 mutation). Results were compared with those of M27-A2. The MIC endpoint was 100% growth inhibition. Overall agreement (±2 log2) was 87.16%. Sensititre YeastOne detected strains with reduced caspofungin susceptibility.


Revista Iberoamericana De Micologia | 2005

Candidemia: Candida parapsilosis en una unidad de Neonatología

Estrella Durán; Inmaculada Ramírez de Ocáriz; Purificación Ventura; Joaquina Gil; Carmen Rubio

La incidencia de candidemia en las Unidades de Cuidados Intensivos Neonatales (UCIN) ha aumentado considerablemente en la última década, debido al aumento en la supervivencia de los recién nacidos de bajo peso y a los cambios en los procedimientos diagnósticos y terapéuticos. En los recién nacidos el grado de inmunodeficiencia está inversamente relacionado con la edad gestacional y el peso al nacer, siendo los grandes prematuros y los recién nacidos de bajo peso los que tienen mayor riesgo de infección [1]. Con el objeto de estudiar las características de los episodios de candidemia en recién nacidos se han analizado los datos clínicos y microbiológicos de los últimos doce años (1992-2003). Se documentan 22 casos de candidemia correspondientes a 22 pacientes. La incidencia de candidemia fue de 3,4/1000 recién nacidos ingresados. La edad de comienzo de las manifestaciones clínicas fue superior a siete días. De los 22 recién nacidos, 20 eran pretérmino con edad gestacional entre 25 y 36 semanas (media 29,4 semanas) y peso al nacimiento entre 600 y 2160 g (media 1264 g). Entre los años 1992-1997 los recién nacidos ingresados de bajo peso (<2500 g) representaron el 16,6% respecto al 24,6% del periodo 1998-2003. En la primera etapa se obtiene el 18,2% de los aislamientos respecto al 81,8% de la segunda. Candida parapsilosis fue la especie predominante aislándose en el 77,3% de los pacientes, seguida por Candida albicans (13,6%), Candida glabrata (4,5%) y Candida lusitaniae (4,5%). En las candidosis sistémicas, el patógeno dominante es C. albicans que puede ser adquirido por transmisión vertical de madre a hijo [7] u horizontalmente por las manos del personal sanitario [3]. En nuestro estudio C. parapsilosis fue el primer agente causal de candidemia coincidiendo con otras publicaciones [4,5]. Esta especie puede producir una película en las soluciones que contienen glucosa permitiéndole la adhesión a los catéteres de nutrición parenteral [2]. Entre los factores de riesgo para la infección por C. parapsilosis en recién nacidos destacan: la prematuridad, la presencia de catéteres endovenosos, la administración de nutrición parenteral y la antibioterapia previa [5]. En todos nuestros pacientes incidían al menos la presencia de catéter endovenoso central, la nutrición parenteral total y la antibioterapia prolongada, en concordancia con lo descrito en la literatura [2,5]. C. parapsilosis forma parte de la flora endógena y es comensal habitual de la piel penetrando en el torrente circulatorio por la ruptura de la barrera cutánea. En los últimos años se han aportado datos para considerar que en muchas ocasiones la candidemia ocurre como fuente de infección exógena a partir de las manos del personal sanitario, ocasionando brotes de infección nosocomial [6]. Ello hace necesario la implantación de técnicas de tipificación molecular que permitan averiguar la fuente de infección y la diseminación clonal o no de la misma y es donde debe dirigirse la investigación para conocer la epidemiología de la colonización e infección por Candida, incluyendo los pacientes colonizados, las manos del personal sanitario y los fómites.


Enfermedades Infecciosas Y Microbiologia Clinica | 2007

Update on invasive fungal infections: the last two years

Carlos Lumbreras; Francisco Álvarez-Lerma; Enric Carreras; José Miguel Cisneros; José Garnacho; Estrella Martín-Mazuelos; Javier Pemán; Guillermo Quindós; Carmen Rubio; Julián Torre-Cisneros; Juan Luis Rodríguez Tudela

Several important changes are taking place in the field of invasive fungal infections. The increasing incidence of invasive fungal infections as a result of progress in areas of medicine such as organ transplantation, cancer therapy or intensive-care medical technology has provided the impetus for a search for a new and more favorable scenario. In addition, pharmaceutical companies have developed new, well-tolerated and more effective broad-spectrum antifungal agents. Therefore, during the last few years, several articles on invasive fungal infections have been published. This review focuses on the new insights in the literature on fungal infections during 2004 and 2005. Three areas of interest have been identified: (i) epidemiology and risk factors, (ii) new diagnostic procedures, and (iii) prevention and treatment. A review of the English-language and Spanish-language literature on invasive fungal infections has been made, and those articles considered essential reading have been reviewed and discussed in order to highlight their original aspects.


Enfermedades Infecciosas Y Microbiologia Clinica | 2003

Absceso primario de psoas por Salmonella enterica serogrupo G serovar friedenau

Estrella Durán; Mercedes Gracia; Joaquina Gil; Carmen Rubio

Sr. Editor: Hemos leído con atención el artículo de García-Irure1 sobre un caso de absceso de psoas por Salmonella enteritidis. Estamos de acuerdo en que se trata de una entidad infrecuente y de difícil diagnóstico por sus manifestaciones clínicas, muchas veces insidiosas, y por la necesidad de recurrir a técnicas de imagen adecuadas debido a su localización. Recientemente hemos tenido un caso similar de absceso de psoas por S. enterica serovar friedenau en una paciente joven previamente sana. Lo inusual de la etiología, así como las características de sensibilidad a los antimicrobianos nos llevan a su descripción. Se trataba de mujer de 17 años que ingresó por presentar desde hacía 2 semanas fiebre de predominio vespertino y dolor en articulación coxofemoral izquierda tras esfuerzo deportivo con diagnóstico de bursitis trocantérea izquierda. Como antecedentes refería un cuadro de gastroenteritis no clasificada coincidiendo con un viaje a Marruecos un mes antes. A la exploración física: paciente febril (38,2 °C) con destacada actitud antiálgica de cadera izquierda en rotación externa, bloqueo de la rotación interna y palpación dolorosa en zona inguinal y en fosa ilíaca izquierda. Es destacable: leucocitosis (17.100/ l: 86,40% neutrófilos; linfocitos, 9,70%, y 3%, monocitos); VSG y PCR elevadas; serología a Brucella negativa y a Salmonella typhi positiva; prueba de Mantoux negativa; estudio de la inmunidad humoral y celular normal y serología a VIH negativa. No se realizaron hemocultivos y tres coprocultivos fueron negativos. Las radiografías de tórax, abdomen y columna lumbar no evidenciaron alteraciones. La ecografía abdominal detectó una masa líquida ovoide de 7 × 2 cm en fosa ilíaca izquierda rodeando al músculo psoas ilíaco. En la tomografía computarizada (TC) abdominopélvica y resonancia magnética (RM) se apreciaba un absceso retroperitoneal extenso, siguiendo el trayecto del psoas ilíaco izquierdo. Las exploraciones ginecológicas y urológicas, enema opaco, cavitograma y gammagrafía con leucocitos marcados fueron normales. Del material purulento obtenido mediante drenaje percutáneo se aisló S. enterica serogrupo G serovar friedenau sensible a betalactámicos, monobactámicos, carbapenemes, aminoglucósidos, cloranfenicol y quinolonas. La paciente fue tratada con ceftriaxona 1 g/12 h/15 días por vía intravenosa y drenaje con lavados con suero fisiológico durante 13 días. Fue dada de alta a los 16 días de su ingreso y se le prescribió ciprofloxacino (500 mg/12 h/10 días). En un control, a los 3 meses de finalizado el tratamiento, la paciente permanecía asintomática. Los abscesos primarios del psoas son aquellos de causa desconocida en los que no se consigue demostrar ningún foco infeccioso contiguo al músculo como origen del mismo. Su incidencia es variable. Es superior al 95% en países subdesarrollados y tropicales (Asia, África), el 60% en Estados Unidos y Canadá, y del 20% o menos en Europa. Suelen ser unilaterales (98%) sin localización predominante, y más frecuentes en personas de edad inferior a 30 años y en varones (75%)2. Actualmente, el 88% están producidos por Staphylococcus aureus y son monomicrobianos en el 87%3. En los abscesos secundarios no hay una clara relación con la edad, ni el sexo; dos tercios se localizan en el lado derecho2,4 y los microorganismos entéricos son los aislados con mayor frecuencia3. El porcentaje de bacteriemia tras gastroenteritis por S. enterica no typhi, en el adulto sano, oscila del 1-13% y sólo el 8-10% se complica con infecciones focales. Si bien la localización osteoarticular representa aproximadamente la tercera parte de los casos de salmonelosis focal5, la afectación del músculo psoas no es muy frecuente3,6-9. En el caso clínico descrito cabe destacar:


International Journal of Antimicrobial Agents | 2000

Aminoglycoside-modifying enzymes in high-level streptomycin and gentamicin resistant Enterococcus spp. in Spain

R. del Campo; Carmen Tenorio; Carmen Rubio; J Castillo; Carmen Torres; Rafael Gómez-Lus

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Javier Pemán

Instituto Politécnico Nacional

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Emilia Cantón

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Estrella Martín-Mazuelos

Spanish National Research Council

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Guillermo Quindós

University of the Basque Country

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