Eustáquio Souza Dias

Succession of bacterial and fungal communities during natural coffee (Coffea arabica) fermentation

Bacteria, yeasts and filamentous fungi were isolated during natural coffee processing. Bacteria were isolated in greater numbers at the beginning of the fermentation, when the moisture of the coffee beans was around 68%. Gram-positive bacteria represented 85.5% of all bacteria isolated, and Bacillus was the predominant genus (51%). Gram-negative species of the genera Serratia, Enterobacter and Acinetobacter were also found. Approximately 22% of 940 randomly chosen isolates of microorganisms were yeasts. Debaryomyces (27%), Pichia (18.9%) and Candida (8.0%) were the most commonly found genera, and these three genera tended to appear more often as the fruit was fermented and dried. Aspergillus was the most abundant genus besides Penicillium, Fusarium and Cladosporium, with 42.6% of the total fungi isolates. The genera and species identified included members known to have pectinase and cellulase activities. Of the 10 organic acids analyzed and quantified in coffee beans, acetic and lactic acids may have been generated by microbial activity. Butyric acid was not detected in any sample.

Determination of dynamic characteristics of microbiota in a fermented beverage produced by Brazilian Amerindians using culture-dependent and culture-independent methods.

Cauim is a fermented beverages prepared by Tapirapé Amerindians in Brazil from substrates such as cassava, rice, peanuts, pumpkin, cotton seed and maize. Here we study the microorganisms associated with peanut and rice fermentation using a combination of culture-dependent and -independent methods. The bacterial population varied from 7.4 to 8.4 log CFU/ml. The yeast population varied from 4.0 to 6.6 log CFU/ml. A total of 297 bacteria and yeasts strains were isolated during fermentation, with 198 bacteria and 99 yeast. The Lactobacillus genus was dominant throughout fermentation. Bacteria and yeast community dynamics during the fermentation process were monitored by PCR-DGGE analysis. Both culture-dependent and -independent methods indicated that the bacterial species L. plantarum, L. fermentum, L. paracasei and L. brevis as well as the yeast species P. guilliermondii, K. lactis, Candida sp, R. toruloides and Saccharomyces cerevisiae, were dominant during fermentation. Multivariate analysis of microorganisms during beverage fermentation showed that the microbial community changed during the fermentation process.

Cultivo do cogumelo Pleurotus sajor-caju em diferentes resíduos agrícolas

Diferentes residuos agricolas disponiveis na regiao sul de Minas Gerais foram testados para o cultivo do cogumelo Pleurotus sajor-caju. Foram avaliados os seguintes substratos: palha de feijao pura (PFP), palha de milho pura (PMP), casca de cafe pura (CCP), palha de feijao enriquecida com 2% de calcario, 2% de gesso e 10% de farelo de trigo (PFE), palha de milho enriquecida (PME) e casca de cafe enriquecida (CCE). Todos os substratos receberam 2% de inoculante e foram incubados a 24°C. Apos a colonizacao, os sacos foram mantidos abertos em ambiente a 24°C e umidade a 80%. PFP, PFE e PME apresentaram os melhores resultados na producao de cogumelos, com uma eficiencia biologica de 85,7; 81,4 e 83,4%, respectivamente. A palha de feijao foi considerada o melhor residuo para a producao do cogumelo P. sajor-caju, porque apresentou a melhor eficiencia biologica sem necessidade de enriquecimento.

Genetic characterization of isolates of the basidiomycete Agaricus blazei by RAPD

The genetic divergence of five isolates of Agaricus blazei was determined based on RAPD data. Results indicate that there is little genetic variability among the commercialized strains and that RAPD is a feasible and low cost technique that can be used to characterize this fungus.

Truths and myths about the mushroom Agaricus blazei

O cogumelo Agaricus blazei Murrill foi descoberto na cidade de Piedade, Estado de Sao Paulo, Brasil, e enviado para o Japao para o estudo das suas propriedades medicinais. Com a descoberta das suas propriedades antitumorais, comprovadas em cobaias, o Japao passou a importar esse cogumelo do Brasil. Devido ao seu elevado preco no mercado internacional, muitas empresas e produtores rurais passaram a buscar nesse cogumelo uma nova alternativa de renda. Diante de um interesse tao repentino, nao houve tempo para que a comunidade cientifica pesquisasse o assunto, de maneira que a tecnologia de cultivo e ainda muito empirica. Alem disso, existem informacoes contraditorias acerca da classificacao desse cogumelo e as suas propriedades antitumorais ainda precisam ser confirmadas em seres humanos.

Mushroom cultivation in Brazil: challenges and potential for growth.

O cultivo de cogumelos esta em franca expansao no Brasil, gracas a descoberta de suas propriedades medicinais e culinarias pelo povo brasileiro e tambem em funcao da melhoria das condicoes economicas. Entretanto, ha ainda uma necessidade de desenvolvimento de uma tecnologia de cultivo apropriada para as condicoes brasileiras. Durante muitos anos, a tecnologia de cultivo de cogumelos utilizada no Brasil foi uma adaptacao daquela utilizada nos paises desenvolvidos, cujas condicoes climaticas e disponibilidade de materia-prima sao diferentes do Brasil. Portanto, para que se possa desenvolver todo o potencial brasileiro para o cultivo de cogumelos, e essencial o desenvolvimento de tecnologias de cultivo mais apropriadas para a agricultura familiar, mas tambem e importante o desenvolvimento tecnologico voltado para o cultivo de cogumelos em escala industrial. As principais especies de cogumelos cultivados no Brasil sao discutidas neste trabalho, alem da indicacao das principais necessidades de pesquisa para o futuro.

Cultivation of Agaricus blazei ss. Heinemann using different soils as source of casing materials.

Commercial productivity of the Agaricus blazei mushroom is closely related to both the quality of the compost and the choice of soil to be used as a casing material. This study aims to evaluate Agaricus blazeis productivity using two compost formulations and three soils. The two compost formulations were (i) crushed sugarcane bagasse (Saccharum officinarum (L.)) and Coastcross hay (Cynidon dactylon (L.) Pers.), and (ii) crushed sugarcane bagasse (Saccharum officinarum (L.)) and corn husk (Zea mays L.); they were amended with wheat bran, lime, gypsum, superphosphate and urea. The casing materials were extracted from three soils classed as Rhodic Hapludox, Xanthic Hapludox, and Humic Haplaquox. The Rhodic Hapludox soil material was mixed with fragments of Eucalyptus charcoal in the proportion of 4:1. The compost was prepared during six weeks and thereafter heat treated during 48 h at the end of the composting period. The sugarcane bagasse:coast-hay compost was superior to the sugarcane bagasse: corn husk compost. The Rhodic Hapludox plus charcoal casing material showed to be a better casing material than either the Xanthic Hapludox and Humic Haplaquox soil materials. The choice of the soils where the casing material is taken is an important factor to the success of the Agaricus blazei mushroom cultivation.

Microbial diversity in a bagasse-based compost prepared for the production of Agaricus brasiliensis.

Os cogumelos comestiveis sao apreciados pelas suas propriedades nutricionais e medicinais e, por essa razao, possuem alto valor economico. A producao de cogumelos depende da composicao quimica dos substratos basicos, dos suplementos utilizados e da preparacao do composto no qual o fungo sera cultivado. Considerando-se que os custos de producao precisam ser minimizados, os residuos agroindustriais representam uma fonte alternativa e economica para a preparacao do composto. A interacao da microbiota natural dos residuos agricolas durante o processo de compostagem influencia a subsequente colonizacao do cogumelo. Visando-se a producao de A. brasiliensis, o presente trabalho objetivou isolar e identificar a microbiota presente no composto preparado a partir de bagaco de cana e capim coast-cross. O processo de compostagem durou 14 dias com reviragens da pilha a cada dois dias, o qual foi seguido de pasteurizacao (55 65 oC) em duas fases por 15 h cada. As bacterias (principalmente Bacillus, Paenibacillus e especies da familia Enterobacteriaceae) foram os microrganismos predominantes durante todo o processo com uma densidade populacional media de 3.0 x 108 UFC/g. Os actinomicetos, principalmente os do genero Streptomyces, estiveram bem representados, com uma densidade populacional de 2.0 a 3.0 x 108 UFC/g. Os fungos filamentosos foi a classe de microrganismos com menor densidade populacional e menor diversidade, embora a especie Aspergillus fumigatus esteve presente durante todo o processo de compostagem e tambem apos a pasteurizacao do composto.

Variabilidade genética de isolados do cogumelo Agaricus blazei por meio de marcadores RAPD

Agaricus blazei (Murrill) ss. Heinem. e um cogumelo nativo do Brasil que vem despertando a atencao de varios pesquisadores em todo o mundo, devido as suas propriedades farmacologicas e nutricionais. Este trabalho teve por objetivo, analisar a variabilidade genetica de alguns isolados utilizados comercialmente, por meio de marcadores RAPD. Foram analisados nove isolados de A. blazei, provenientes de diferentes regioes do Brasil e, como controle, dois isolados de A. bisporus. Todos eles fazem parte da colecao de fungos do Laboratorio de Cogumelos Comestiveis e Medicinais do DBI/UFLA. Diferentes primers aleatorios foram utilizados, gerando um total de 139 bandas polimorficas. Procedeu-se a avaliacao de similaridade genetica entre os isolados pelo coeficiente de Dice e analise de agrupamento pelo metodo UPGMA. Os resultados revelaram que dos 9 isolados de A. blazei, 6 (CS1, CS3, CS4, CS6, CS8 e CS9) apresentaram uma alta similaridade genetica, sendo considerados isolados de uma mesma origem ou clones. O isolado CS2 foi o que apresentou a maior divergencia genetica em relacao aos demais, seguido dos isolados CS5 e CS7, os quais formaram cada um, um grupo a parte, com medias de 60,6%, 88,7% e 91,3% de similaridade genetica, respectivamente.

Análise química de corpos de frutificação de Pleurotus sajor-caju cultivado em diferentes concentrações de nitrogênio

Mushrooms of Pleurotus genus usually grow well in substrates containing low amounts of nitrogen, whereas Agaricus mushrooms require substrates with a high content of nitrogen. On the other hand, the nutritional values of mushrooms depend on the chemical composition of the substrate in use and the conditions of cultivation. The aim of this work is to measure the protein content of the fructification bodies of Pleurotus sajor-caju cultivated in coast-cross grass, sugar cane bagasse, whole wheat meal and various nitrogen concentrations. Only the substrates with nitrogen content ranging from 0.65 to 1.30% were colonized, while in the substrates with 1.75 and 2.20% of nitrogen, colonization did not occur. There was no significant difference in the production of mushrooms, however the protein content of the mushrooms produced on the substrate with 1.30% of N was considerably higher in relation to those mushrooms grown in substrates with a reduced nitrogen content.