Giuliana Fabio

Commercial DNA Probes for Mycobacteria Incorrectly Identify a Number of Less Frequently Encountered Species

ABSTRACT Although commercially available DNA probes for identification of mycobacteria have been investigated with large numbers of strains, nothing is known about the ability of these probes to identify less frequently encountered species. We analyzed, with INNO LiPA MYCOBACTERIA (Innogenetics) and with GenoType Mycobacterium (Hein), 317 strains, belonging to 136 species, 61 of which had never been assayed before. INNO LiPA misidentified 20 taxa, the majority of which cross-reacted with the probes specific for Mycobacterium fortuitum and the Mycobacterium avium-Mycobacterium intracellulare-Mycobacterium scrofulaceum group. GenoType misidentified 28 taxa, most of which cross-reacted with M. intracellulare and M. fortuitum probes; furthermore, eight species were not recognized as members of the genus Mycobacterium. Among 54 strains investigated with AccuProbe (Gen-Probe), cross-reactions were detected for nine species, with the probes aiming at the M. avium complex being most involved in cross-reactions.

A rare case of localized mucosal leishmaniasis due to Leishmania infantum in an immunocompetent Italian host.

The case of authoctonous isolated laryngeal leishmaniasis due to L. infantum in an italian immunocompetent host is reported. It is highlighed the need to consider mucosal leishmaniasis in the differential diagnosis of laryngeal tumors. Rapid nested-PCR technique and enzyme restriction analysis were useful for diagnosis and species identification directly from bioptic samples.

Search for human herpesvirus 6 and human cytomegalovirus in bronchoalveolar lavage from patients with human immunodeficiency virus-1 and respiratory disorders

Virus isolation and viral DNA detection by the polymerase chain reaction were used to investigate the presence of human herpesvirus 6 (HHV‐6) and human cytomegalovirus (HCMV) in bronchoalveolar lavage from 34 human immunodeficiency virus‐1 (HIV‐1)‐infected patients with respiratory disorders. The aim was to assess the presence of reactivated HHV‐6 in lung tissues for a subsequent evaluation of the frequency of virus involvement in respiratory clinical manifestations in the course of HIV‐1 infection. Bronchoalveolar lavage samples were tested for the presence of HCMV, as a routine investigation within a protocol monitoring opportunistic infections in symptomatic HIV‐1 patients. Whereas HCMV DNA was detected by the polymerase chain reaction in 12 bronchoalveolar lavage specimens, 10 of which were also positive for virus isolation, all samples were negative for HHV‐6 by both virological procedures. The HHV‐6 DNA finding in bronchoalveolar lavage from an HIV‐1‐seronegative patient with renal carcinoma, investigated accidentally together with the bronchoalveolar lavage specimens from HIV‐1 seropositive patients, stressed the HHV‐6 polymerase chain reaction‐negative results in the bronchoalveolar lavage samples under study. It is concluded that the lung may be a target organ for HCMV infection in HIV‐1‐seropositive patients affected by respiratory symptoms but that this does not seem to be the case for HHV‐6.

RIPETUTI CLUSTERS DA S. MARCESCENS IN UN REPARTO DI TERAPIA INTENSIVA NEONATALE: ASPETTI MICROBIOLOGICI E CLINICO-EPIDEMIOLOGICI

Introduzione. Serratia marcescens è stata segnalata negli ultimi anni come causa di epidemie, talora difficili da eradicare, in reparti di terapia intensiva neonatale. Scopo della ricerca è la valutazione degli aspetti microbiologici e clinicoepidemiologici di ripetuti clusters di infezioni da S. marcescens, occorsi nel reparto di Neonatologia del Policlinico di Modena nell’arco di 3 anni. Metodi. È stato condotto uno studio molecolare con RFLPPCR su ceppi di S.marcescens isolati da campioni clinici di 55 neonati. Sono stati valutati i fattori di rischio e le misure di controllo intraprese. Risultati. 38 bambini erano colonizzati e 17 affetti da infezioni di diversa gravità; di questi 6, prematuri di basso peso, hanno sviluppato setticemia ed uno è deceduto. La tipizzazione molecolare dei ceppi ha identificato 7 diversi genotipi (A-G) dei quali due prevalenti: A, 12 casi, e B, 27 casi. Complessivamente sono stati riscontrati 4 clusters di diversa entità: I, gennaio aprile 2003, 9 casi, genotipo A; II, luglio 2003, 3 casi, genotipo B; III, gennaio giugno 2004, 20 casi, genotipi C (8), B (5), D (2), E (3); IV, giugno 2005 febbraio 2006, 24 casi, genotipi A (3), B (18), C (1), G (1). Ripetuti campioni prelevati dall’ambiente e dal personale sono risultati costantemente negativi. I principali fattori di rischio identificati sono stati: basso peso alla nascita, prematurità, ventilazione forzata e catetere venoso centrale. Conclusioni. Genotipi eterogenei sono stati riscontrati nei ceppi studiati. I cloni A e B identificati nei primi 2 clusters, sono stati nuovamente repertati dopo 3 anni nell’ultimo cluster, dimostrando una persistenza nell’ ambiente. Non è stata identificata una fonte comune. Il sovraffollamento del reparto in rapporto al calo del personale è stato collegato ai clusters di infezioni. La trasmissione crociata tramite le mani è stata probabilmente una importante via di diffusione. Screening microbiologici ravvicinati, cohorting degli infetti e implementazione delle misure igieniche sono risultati aspetti fondamentali nel contenimento dell’epidemia. 141