Language
Country/Area
No result found
Как обеспечить точность MNG в процессе отбора проб? Вы знаете эти советы?
Благодаря быстрому развитию технологий клиническое метагеномом секвенирование следующего поколения (MNGS) стало мощным инструментом для диагностики инфекционных заболеваний. Этот метод обеспечивает всесторонний анализ генетического материала из микроорганизмов и хозяев из клинических образцов, не зная конкретного патогена. Тем не менее, как обеспечить точность этой технологии в процессе отбора проб, остается важной проблемой.
Традиционные методы обнаружения патогенов часто нарушаются обработкой образцов и фонового шума, и MNG могут обнаруживать несколько патогенов одновременно, что является его наибольшим преимуществом.
Правильное выполнение выборки
Точность MNGS зависит в первую очередь от правильной сбора образцов. Вообще говоря, кровь, спинномозговая жидкость, мочи и носоглоточные мазки являются наиболее часто используемыми образцами. Эти образцы должны быть собраны с осторожностью, особенно при выполнении травматических процедур, таких как люмбальная пункция, следует избегать перекрестного загрязнения. Чистота образца напрямую влияет на точность последующего секвенирования, поэтому выборка должна выполняться в стерильной среде.
меры предосторожности при экстракции нуклеиновой кислоты
Во время процесса извлечения также крайне важно выбрать правильный набор извлечения. Например, выбор конкретного метода экстракции РНК или ДНК для образцов с высоким шумом окружающей среды может улучшить специфичность и удобство обнаружения патогенов. Процесс экстракции требует обеспечения того, чтобы РНК/ДНК патогена в образце могла быть эффективно извлечена, а влияние фонового шума должно быть сведено к минимуму.
Использование целевых методов обогащения, таких как отрицательный отбор или положительное обогащение, может улучшить скорость обнаружения сигналов патогена в образце.
Выбор высокопроизводительной технологии секвенирования
Во время фазы секвенирования выбор правильной платформы секвенирования также имеет решающее значение для точности результатов. Как правило, система Illumina Miseq является предпочтительной платформой для широко распространенных исследований инфекционных заболеваний, и она работает быстро и имеет сильную поддержку сообщества. С улучшением технологий, другие платформы, такие как Minion, постепенно становятся потенциальными вариантами, особенно для небольших лабораторий с ограниченными ресурсами.
Важность анализа биоинформатики
Анализ данных секвенирования также требует профессиональных знаний о биоинформатике, которые включают очистку данных, сдвиг и дедупликацию для повышения точности результатов. Удаление чтения из генома хозяина для уменьшения фонового шума является критическим шагом в этом процессе. Кроме того, результаты анализа должны сравниваться с общедоступной базой данных для определения организационного объема, что обеспечивает надежность последующих результатов.
Стратегии для решения проблем
В настоящее время реализация MNGS сталкивается со многими клиническими проблемами, такими как клиническая практичность, лабораторная эффективность и стоимость. Следовательно, постоянное улучшение этих процессов и технологий является важной частью обеспечения точности обнаружения MNGS. Целевой мониторинг и установление справочных стандартов могут способствовать их эффективному применению в медицинском сообществе.
Сочетание традиционного микробного тестирования и технологии MNGS может повысить чувствительность и точность диагностики, особенно при мониторинге сложных инфекций.
Foresight Reflection
Будущее развитие MNGS не только зависит от технологического прогресса, но и требует обширного признания и клинической проверки от медицинского сообщества. По мере расширения применения применения больше случаев демонстрируют их ценность в диагностике инфекционных заболеваний. Готовы ли мы к революционным изменениям, вызванным этой технологией?
