Language
Country/Area
No result found
Почему традиционные ПЦР-тесты иногда не дают результата, а mNGS раскрывает правду?
В современном медицинском мире существуют различные способы диагностики инфекционных заболеваний, среди которых традиционный тест полимеразной цепной реакции (ПЦР) всегда был важным инструментом, на который полагаются врачи и лаборатории. Однако с развитием технологий клиническая метаболическая геномика (mNGS) постепенно продемонстрировала свои преимущества по сравнению с традиционной ПЦР, особенно в тех случаях, когда ПЦР-тестирование в некоторых случаях не может дать четких результатов.
mNGS — это передовая технология генетического секвенирования, которая позволяет проводить комплексный анализ генетического материала микроорганизмов и хозяина из клинических образцов без необходимости предварительного знания конкретных патогенов. Традиционные ПЦР-тесты часто основываются на предварительной идентификации конкретного возбудителя, что затрудняет диагностику в случаях, когда возбудитель неизвестен.
По сравнению с ПЦР, mNGS использует беспристрастный метод анализа и может идентифицировать все потенциальные патогены путем секвенирования всех геномов в образце. Эта особенность делает mNGS особенно важным при лечении инфекций, причина которых неизвестна, особенно после того, как у пациента было несколько отрицательных результатов ПЦР-тестов.На чувствительность и специфичность традиционных ПЦР-тестов влияют многие факторы, включая концентрацию возбудителя, качество образца и наличие ингибиторов.
Преимущества и сценарии применения mNGS
Благодаря mNGS врачи могут получить исчерпывающую информацию о причине инфекции за один тест. Он способен не только быстро идентифицировать вирусы, бактерии, грибки и паразитов, но и обнаруживать несколько инфекций одновременно. Исследования показали, что mNGS более эффективен, чем традиционные методы, при диагностике таких заболеваний, как менингит, миелит и тяжелая пневмония.
Тестирование образцов спинномозговой жидкости методом mNGS может выявить патогены, которые не обнаруживаются при традиционном тестировании, что имеет решающее значение для выбора вариантов лечения.
Ограничения традиционной ПЦР
Хотя технология ПЦР-детекции достигла значительного прогресса, она все еще имеет свои ограничения. Во-первых, для ПЦР-тестирования требуются специфические праймеры, и если возбудитель ранее не был идентифицирован, ПЦР может его не обнаружить. Кроме того, фоновый шум, качество образца и неправильная эксплуатация могут привести к ложноотрицательным результатам. Это особенно заметно в двух ситуациях: когда значение Ct возбудителя высокое и в сомнительных случаях.
Экспериментальный процесс mNGS
Процесс mNGS включает сбор образцов, извлечение РНК/ДНК, высокопроизводительное секвенирование и биоинформатический анализ. Каждый этап этой серии процессов требует точности и чистоты для предотвращения загрязнения. Особенно на этапах извлечения образцов и подготовки библиотеки часто возникает необходимость сосредоточиться на устранении фонового шума, чтобы повысить точность обнаружения сигналов патогенов.
Высокопроизводительная технология секвенирования позволяет за один тест генерировать большой объем данных, что обеспечивает гарантию последующего анализа и интерпретации данных.
Применение mNGS в исследовании устойчивости к антибиотикам
Поскольку проблема устойчивости к антибиотикам становится все более серьезной, использование технологии mNGS для выявления генетических вариаций устойчивости микроорганизмов стало важным направлением исследований. mNGS может выявить разнообразие генов лекарственной устойчивости и помочь открыть новые механизмы лекарственной устойчивости.
Кроме того, mNGS также продемонстрировал большой потенциал в мониторинге эпидемий, особенно на ранних стадиях реагирования на эпидемию. Его способность изначально выявлять потенциальные патогены делает его передовым инструментом для мониторинга общественного здравоохранения.
Проблемы и будущее развитие mNGS
Хотя mNGS постепенно становится новым стандартом диагностики, его клиническое внедрение все еще недостаточно и сталкивается с такими проблемами, как стоимость, лабораторная валидация и анализ данных. В будущем необходимо провести больше клинических исследований для подтверждения его конкретного применения. В то же время ожидается, что благодаря постоянному совершенствованию технологий и установлению соответствующих стандартов mNGS станет основным инструментом клинической диагностики.
В этом процессе нам также необходимо подумать о том, смогут ли традиционные диагностические инструменты продолжать справляться с вызовами новых патогенов, которые могут появиться в будущем, или же следует более широко внедрять новые технологии, такие как mNGS, чтобы раскрыть правду?
