Language
Country/Area
No result found
Почему mNGS — супергерой, когда дело касается диагностики инфекций?
С развитием технологий традиционные методы диагностики патогенов сталкиваются с беспрецедентными проблемами. Клиническое метаболическое геномное секвенирование нового поколения (mNGS) постепенно показало свои уникальные преимущества, особенно в диагностике сложных инфекционных заболеваний. Его всеобъемлющие возможности обнаружения делают его таким же важным, как супергерой.
Клиническое метаболическое геномное секвенирование нового поколения обеспечивает возможность комплексного обнаружения потенциальных патогенов, что особенно ценно, когда традиционные методы трудно применимы.
Что такое mNGS?
mNGS относится к анализу генетического материала (ДНК или РНК) микроорганизмов и хозяев в клинических образцах с помощью технологии секвенирования нового поколения без необходимости знать конкретный патоген. Ключевым преимуществом этого подхода является его способность обнаруживать несколько патогенов одновременно, особенно когда другие, более целенаправленные методы обнаружения (например, ПЦР) не дают результата.
Рабочий процесс в лаборатории
Типичный рабочий процесс mNGS включает сбор образцов, извлечение РНК/ДНК, подготовку исходного материала, высокопроизводительное секвенирование и биоинформатический анализ. Качество сбора образцов напрямую влияет на результаты теста, поэтому его следует проводить с осторожностью.
Сбор и извлечение образцов
Наиболее часто используемые источники образцов включают кровь, кал, спинномозговую жидкость (СМЖ), мочу и мазки из носоглотки. При извлечении образцов выбирайте соответствующий набор для экстракции, чтобы исключить фоновые помехи и сосредоточиться на РНК или ДНК патогена.
Подготовка материала и высокопроизводительное секвенирование
Из-за влияния фонового шума стратегии по усилению сигналов патогенов приобретают особое значение. Выбор платформы высокопроизводительного секвенирования зависит от исследовательских целей и опыта лаборатории. В настоящее время наиболее распространенным выбором является система Illumina MiSeq, но новые технологии, такие как MinION, также демонстрируют большой потенциал.
Усовершенствование технологии высокопроизводительного секвенирования сделало чувствительный ко времени мониторинг и эпидемиологические приложения для различных неизвестных причин более оперативными и точными.
Применение mNGS
mNGS демонстрирует значительный потенциал в диагностике инфекционных заболеваний, особенно патогенов, которые невозможно обнаружить традиционными методами обнаружения. Например, mNGS превосходит традиционные микробиологические исследования при диагностике менингита и энцефалита.
Изучение устойчивости к антибиотикам
Поскольку устойчивость к антибиотикам становится все более серьезной проблемой, mNGS предоставляет новый способ обнаружения и характеристики этих генов, помогая медицинскому сообществу лучше понять и решить эту проблему.
Проблемы и перспективы на будущее
Хотя mNGS находит применение во многих областях, все еще необходимо решить такие проблемы, как его клиническая полезность, лабораторная валидность и экономичность. Многие исследования все еще находятся на стадии описания случаев и не имеют широкого клинического применения.
ЗаключениеВ будущем, если текущие проблемы будут преодолены, mNGS продемонстрирует свою незаменимую ценность в области общественного здравоохранения, профилактики и контроля эпидемий.
С учетом того, что спрос на быстрые диагностические инструменты продолжает расти, станет ли mNGS более распространенной и стандартной практикой в диагностике инфекционных заболеваний в будущем?
