Language
Country/Area
No result found
كيف يعمل mNGS بدون مسببات الأمراض المعروفة؟
مع تقدم العلوم والتكنولوجيا، يتم ابتكار طرق التشخيص في علم الأحياء الدقيقة السريرية باستمرار. من بينها، تعتبر تقنية تسلسل الجيل القادم من الميتاجينوميات السريرية (mNGS) ابتكارًا ثوريًا، خاصة عند مواجهة مسببات الأمراض غير المعروفة، فإن إمكاناتها غير محدودة. يتيح mNGS للعاملين الطبيين تحديد مسببات الأمراض بسرعة ودقة من العينات السريرية دون معرفة مسبقة بمسببات الأمراض المحددة، وهو أمر بالغ الأهمية للتشخيص والعلاج في نقطة الرعاية.
لا يستطيع mNGS تحديد البكتيريا المسببة للأمراض والفطريات والطفيليات وما إلى ذلك فحسب، بل يمكنه أيضًا تحليل الفيروسات المحتملة، مما يؤدي إلى تحسين دقة تشخيص الأمراض المعدية بشكل كبير.
مقدمة لعملية mNGS
تتضمن عملية تشغيل mNGS عادةً جمع العينات واستخراج الحمض النووي الريبي/الحمض النووي الريبوزي (RNA/DNA) وإعداد المكتبة والتسلسل عالي الإنتاجية وتحليل بيانات المعلوماتية الحيوية. تؤثر جودة العينة بشكل مباشر على دقة النتائج، حيث تعتبر عينات الدم والسائل النخاعي نظيفة نسبيًا، في حين قد يحتوي البراز والبول على أعداد كبيرة من الكائنات الحية الدقيقة المقيمة.
جمع العينات واستخراجها
يعد جمع العينات الخطوة الأولى في نظام mNGS، والذي يجب إجراؤه في ظل ظروف معقمة لتجنب تلوث العينة. يتم بعد ذلك استخراج الحمض النووي الجينومي والحمض النووي الريبي (RNA) من العينة باستخدام مجموعات الاستخراج لتحليل المصب. تشتمل مجموعات الاستخراج الشائعة على مجموعة RNeasy PowerSoil Total RNA من شركة Qiagen، وما إلى ذلك.
تحسين تكنولوجيا إعداد المكتبة
نظرًا لوجود ضوضاء في الخلفية، يعد التحسين أثناء إعداد المكتبة أمرًا بالغ الأهمية. يتم استخدام العديد من التقنيات مثل الاختيار السلبي والإثراء الإيجابي لزيادة احتمال اكتشاف إشارات مسببات الأمراض. يحافظ الاختيار السلبي على الأحماض النووية المسببة للأمراض عن طريق إزالة الخلفية من جينومات المضيف والميكروبات، بينما يركز الإثراء الإيجابي على تحسين اكتشاف إشارات مسببات الأمراض.
يعتمد اختيار التسلسل عالي الإنتاجية على أهداف البحث والخبرة ومستوى المهارة لكل مختبر. وفي الوقت الحالي، يعد نظام Illumina MiSeq هو النظام الأساسي الأكثر إثباتًا واستخدامًا على نطاق واسع.
تطبيق mNGS على الأمراض المعدية
أحد التطبيقات الرئيسية لـ mNGS في تشخيص الأمراض المعدية هو قدرته على إجراء الكشف المستهدف وغير المستهدف. غالبًا ما يكون الاختبار المستهدف أكثر حساسية لاكتشاف الكائنات الحية الدقيقة المعروفة، في حين أن الاختبار غير المستهدف يمكنه تحليل العينات بشكل شامل بطريقة تشمل الجينوم.
بالنسبة للأمراض المعدية التي يصعب تشخيصها، مثل الالتهاب الرئوي الذي لا يمكن تحديد سببه بدقة، توفر mNGS حلاً فعالاً من حيث التكلفة، وهو أمر مهم بشكل خاص أثناء الأوبئة مثل كوفيد-19.
تحليل الحالة والتحديات
أكدت العديد من الدراسات استخدام mNGS في الأمراض الحادة مثل التهاب السحايا، والتهاب النخاع، والإنتان، فهو لا يوفر تحديدًا دقيقًا لمسببات الأمراض فحسب، بل يساعد أيضًا في مراقبة الأوبئة في المستشفيات. ومع ذلك، فإن التطبيق السريري لـ mNGS لا يزال يواجه بعض التحديات، بما في ذلك قضايا مثل المنفعة السريرية، وموثوقية المختبر، والتكلفة.
في الوقت الحالي، يتم تقديم معظم نتائج mNGS كتقارير حالة، مما يعيق تعميمها في علم الأحياء الدقيقة السريري ولا يزال التشخيص الحقيقي والفعال يتطلب المزيد من البحث والممارسة لإثباته.
النظرة المستقبلية
في مواجهة الأمراض الوبائية المحتملة، فإن تطوير تكنولوجيا mNGS سيزيد من تعزيز قدرات الاستجابة للصحة العامة. ومع تقدم التكنولوجيا، من المتوقع أن تزداد تطبيقاتها في مجالات مثل مراقبة مسببات الأمراض، وأبحاث مقاومة المضادات الحيوية، وتحليل الميكروبيوم، مما يؤدي في النهاية إلى تعزيز تقدم الطب الحديث.
هل سنرى mNGS يصبح أداة كشف روتينية للتشخيص السريري في المستقبل القريب والقضاء على المزيد من مسببات الأمراض غير المعروفة؟
