مع التطور السريع للتكنولوجيا ، أصبح تسلسل الجيل التالي من الميتاجينوم (MNGS) أداة قوية لتشخيص الأمراض المعدية. تتيح هذه التقنية تحليلًا شاملاً للمواد الوراثية من الكائنات الحية الدقيقة والمضيفين من العينات السريرية دون معرفة مسببات الأمراض المحددة. ومع ذلك ، فإن كيفية ضمان دقة هذه التكنولوجيا أثناء عملية أخذ العينات تظل تحديًا مهمًا.
غالبًا ما يتم إزعاج طرق الكشف عن العوامل الممرضة التقليدية عن طريق معالجة العينات وضوضاء الخلفية ، ويمكن لـ MNGs اكتشاف مسببات الأمراض المتعددة في نفس الوقت ، وهو أكبر ميزة لها.
تعتمد دقة MNGS أولاً على جمع العينات الصحيحة. بشكل عام ، الدم ، السائل النخاعي ، البول ومسحات البلعوم الأنفي هي العينات الأكثر استخدامًا. يجب جمع هذه العينات بحذر ، خاصة عند إجراء الإجراءات المؤلمة مثل ثقب القطني ، يجب تجنب التلوث المتبادل. تؤثر نظافة العينة بشكل مباشر على دقة التسلسل اللاحق ، لذلك يجب إجراء أخذ العينات في بيئة معقمة.
أثناء عملية الاستخراج ، من الأهمية بمكان اختيار مجموعة الاستخراج الصحيحة. على سبيل المثال ، يمكن أن يؤدي تحديد طريقة استخراج الحمض النووي الريبي أو الحمض النووي المحددة للعينات ذات الضوضاء البيئية العالية إلى تحسين خصوصية وراحة اكتشاف العوامل الممرضة. تتطلب عملية الاستخراج التأكد من استخراج RNA/DNA الممرض في العينة بشكل فعال ويجب تقليل تأثير ضوضاء الخلفية.
باستخدام طرق الإثراء المستهدفة ، مثل الاختيار السلبي أو الإثراء الإيجابي ، يمكن أن يحسن معدل اكتشاف إشارات الممرض في العينة.
خلال مرحلة التسلسل ، يعد اختيار منصة التسلسل الصحيحة أمرًا بالغ الأهمية لدقة النتائج. بشكل عام ، فإن نظام Illumina Miseq هو المنصة المفضلة للانتشار على نطاق واسع في أبحاث الأمراض المعدية ، وهو يمتد بسرعة ولديه دعم مجتمعي قوي. مع تحسين التكنولوجيا ، تصبح منصات أخرى مثل Minion خيارات محتملة تدريجياً ، خاصة بالنسبة للمختبرات الصغيرة ذات الموارد المحدودة.
يتطلب تحليل بيانات التسلسل أيضًا معرفة المعلوماتية الحيوية المهنية ، والتي تتضمن تنظيف البيانات والقص وإلغاء البيانات لتحسين دقة النتائج. يعد إزالة القراءات من جينوم المضيف لتقليل ضوضاء الخلفية خطوة حاسمة في هذه العملية. بالإضافة إلى ذلك ، يجب مقارنة نتائج التحليل بقاعدة البيانات العامة لتحديد النطاق التنظيمي ، مما يضمن موثوقية النتائج اللاحقة.
في الوقت الحاضر ، يواجه تنفيذ MNGs العديد من التحديات السريرية ، مثل التطبيق العملية السريرية ، وفعالية المختبر ، والتكلفة. لذلك ، يعد التحسين المستمر لهذه العمليات والتقنيات جزءًا مهمًا من ضمان دقة اكتشاف MNGS. يمكن للمراقبة المستهدفة وإنشاء المعايير المرجعية تعزيز تطبيقها الفعال في المجتمع الطبي.
يجمع بين الاختبارات الميكروبية التقليدية وتكنولوجيا MNGS يمكن أن يحسن حساسية التشخيص والدقة ، خاصة عند مراقبة الالتهابات المعقدة.
لا يعتمد التطور المستقبلي لـ MNGS على التقدم التكنولوجي فحسب ، بل يتطلب أيضًا قبولًا مكثفًا والتحقق السريري من المجتمع الطبي. مع توسيع نطاق التطبيق الخاص به ، تظهر المزيد من الحالات قيمتها في تشخيص الأمراض المعدية. هل نحن مستعدون للتغييرات الثورية الناجمة عن هذه التكنولوجيا؟