في عالم الطب اليوم، هناك طرق مختلفة لتشخيص الأمراض المعدية، ومن بينها اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) التقليدي الذي كان دائمًا أداة مهمة يعتمد عليها الأطباء والمختبرات. ومع ذلك، مع تقدم التكنولوجيا، أظهر ظهور الجينوميات الأيضية السريرية (mNGS) تدريجيًا مزاياها مقارنة بتقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدية، خاصة عندما لا تتمكن اختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل من تقديم نتائج واضحة في بعض الحالات.
mNGS هي تقنية تسلسل جيني متقدمة تتيح إجراء تحليل شامل للمواد الجينية الميكروبية والمضيفة من العينات السريرية دون الحاجة إلى معرفة مسبقة بمسببات الأمراض المحددة. غالبًا ما تعتمد اختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدية على التعرف المسبق على مسببات الأمراض المحددة، مما يجعل التشخيص صعبًا في الحالات التي يكون فيها مسبب الأمراض غير معروف.
بالمقارنة مع تفاعل البوليميراز المتسلسل، يستخدم mNGS طريقة تحليل غير متحيزة ويمكنه تحديد جميع مسببات الأمراض المحتملة عن طريق تسلسل جميع الجينومات في العينة. تجعل هذه الميزة تقنية mNGS مهمة بشكل خاص عند التعامل مع العدوى حيث يكون السبب غير مؤكد، خاصة بعد أن يخضع المريض لاختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل السلبية المتعددة.تتأثر حساسية وخصوصية اختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدية بالعديد من العوامل، بما في ذلك تركيز العامل الممرض، وجودة العينة، ووجود مثبطات.
باستخدام mNGS، يستطيع الأطباء الحصول على معلومات شاملة حول سبب العدوى في اختبار واحد. فهو لا يستطيع التعرف بسرعة على الفيروسات والبكتيريا والفطريات والطفيليات فحسب، بل يمكنه أيضًا اكتشاف العديد من الالتهابات في وقت واحد. وأظهرت الدراسات أن تقنية mNGS أكثر فعالية من الطرق التقليدية في تشخيص أمراض مثل التهاب السحايا والتهاب النخاع والالتهاب الرئوي الشديد.
قد يكشف اختبار mNGS لعينات CSF عن مسببات الأمراض التي فاتتها الاختبارات التقليدية، وهو أمر بالغ الأهمية لاختيار خيارات العلاج.
على الرغم من أن تقنية الكشف عن تفاعل البوليميراز المتسلسل قد حققت تقدمًا كبيرًا، إلا أنها لا تزال لديها حدودها. أولاً، يتطلب اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) بادئات محددة، وإذا لم يتم تحديد العامل الممرض مسبقًا، فقد لا يتمكن اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) من اكتشافه. بالإضافة إلى ذلك، قد تؤدي الضوضاء الخلفية وجودة العينة والتشغيل غير السليم إلى نتائج سلبية خاطئة. ويظهر هذا بشكل خاص في حالتين: عندما تكون قيمة Ct للممرض مرتفعة وفي الحالات المشكوك فيها.
تمكن تقنية التسلسل عالي الإنتاجية اختبارًا واحدًا من إنشاء كمية كبيرة من البيانات، مما يوفر ضمانًا لتحليل البيانات وتفسيرها لاحقًا.
نظرًا لأن مشكلة مقاومة المضادات الحيوية أصبحت خطيرة بشكل متزايد، فقد أصبح استخدام تقنية mNGS للكشف عن الاختلافات الجينية في مقاومة الميكروبات اتجاهًا بحثيًا مهمًا. يمكن أن يكشف mNGS عن تنوع الجينات المقاومة للأدوية ويساعد في اكتشاف آليات مقاومة الأدوية الجديدة.
بالإضافة إلى ذلك، أظهر mNGS أيضًا إمكانات كبيرة في مراقبة الأوبئة، وخاصة في المراحل المبكرة من الاستجابة للوباء، وقدرته على تحديد مسببات الأمراض المحتملة في المقام الأول يجعله أداة متطورة لمراقبة الصحة العامة.
على الرغم من أن mNGS أصبح تدريجياً معياراً تشخيصياً جديداً، إلا أن انتشاره السريري لا يزال غير كاف ويواجه تحديات مثل التكلفة والتحقق المختبري وتحليل البيانات. وفي المستقبل، هناك حاجة إلى المزيد من الدراسات السريرية للتحقق من تطبيقه المحدد. وفي الوقت نفسه، مع التحسين المستمر للتكنولوجيا وإنشاء المعايير ذات الصلة، من المتوقع أن يصبح mNGS أداة رئيسية للتشخيص السريري.
وفي هذه العملية، يتعين علينا أيضاً أن نفكر فيما إذا كانت أدوات التشخيص التقليدية قادرة على الاستمرار في مواجهة تحديات مسببات الأمراض الجديدة التي قد تظهر في المستقبل، أو ما إذا كان ينبغي اعتماد تقنيات جديدة مثل mNGS على نطاق أوسع للكشف عن الحقيقة؟