يوفر تسلسل الجيل التالي من الجينوميات الأيضية السريرية إمكانية الكشف الشامل عن مسببات الأمراض المحتملة، وهو أمر قيم بشكل خاص عندما يكون من الصعب استخدام الطرق التقليدية.ما هو mNGS؟ يشير مصطلح mNGS إلى تحليل المادة الوراثية (DNA أو RNA) للكائنات الحية الدقيقة والمضيفين في العينات السريرية من خلال تقنية التسلسل من الجيل التالي دون الحاجة إلى معرفة العامل الممرض المحدد. إن الميزة الرئيسية لهذا النهج هي قدرته على اكتشاف العديد من مسببات الأمراض في وقت واحد، وخاصة عندما تفشل طرق الكشف الأخرى الأكثر استهدافًا (مثل تفاعل البوليميراز المتسلسل).
يتضمن سير العمل النموذجي لـ mNGS جمع العينات، واستخراج الحمض النووي الريبي/الحمض النووي، وإعداد المخزون، والتسلسل عالي الإنتاجية، وتحليل المعلومات الحيوية. إن جودة جمع العينات تؤثر بشكل مباشر على نتائج الاختبار، لذا يجب أن يتم ذلك بحذر.
تتضمن مصادر العينات الأكثر استخدامًا الدم والبراز والسائل النخاعي (CSF) والبول ومسحات البلعوم الأنفي. عند استخراج العينات، اختر مجموعة الاستخراج المناسبة لاستبعاد التداخلات الخلفية والتركيز على الحمض النووي الريبي أو الحمض النووي للممرض.
نظرًا لتأثير الضوضاء الخلفية، فإن الاستراتيجيات الرامية إلى زيادة إشارات مسببات الأمراض مهمة بشكل خاص. يعتمد اختيار منصة التسلسل عالية الإنتاجية على أهداف البحث وخبرة المختبر. في الوقت الحالي، يعد نظام Illumina MiSeq هو الخيار الأكثر شيوعًا، ولكن التقنيات الناشئة مثل MinION تُظهر أيضًا إمكانات كبيرة.
لقد أدى تحسين تكنولوجيا التسلسل عالي الإنتاجية إلى جعل المراقبة الحساسة للوقت والتطبيقات الوبائية لمختلف الأسباب غير المعروفة أكثر فورية ودقة.
أظهرت تقنية mNGS إمكانات كبيرة في تشخيص الأمراض المعدية، وخاصة بالنسبة لمسببات الأمراض التي لا يمكن تحديد موقعها من خلال طرق الكشف التقليدية. على سبيل المثال، يتفوق اختبار mNGS على الاختبارات الميكروبيولوجية التقليدية في تشخيص التهاب السحايا والتهاب الدماغ.
على الرغم من أن تقنية mNGS لها تطبيقات في مجالات متعددة، إلا أن التحديات مثل فائدتها السريرية، وصلاحيتها المختبرية، واقتصادها لا تزال بحاجة إلى معالجة. لا تزال العديد من الدراسات في مرحلة تقرير الحالة وتفتقر إلى التطبيق السريري الواسع النطاق.
خاتمةفي المستقبل، إذا تم التغلب على التحديات الحالية، فسوف يثبت mNGS قيمته التي لا غنى عنها في مجال الصحة العامة والوقاية من الأوبئة ومكافحتها.
مع استمرار ارتفاع الطلب على أدوات التشخيص السريع، هل سيصبح mNGS أكثر شيوعًا وممارسة قياسية في تشخيص الأمراض المعدية في المستقبل؟