Liliana Muñoz

Perfil microbiológico de aislamientos en unidades neonatales en un hospital de tercer nivel de Bogotá, Colombia

OBJECTIVES: Investigating the prevalence and sensitivity of germs isolated from newborn in a referral hospital in Bogota. Suggesting an empirical antibiotic treatment for neonatal infection. METHODS: Cultures taken between February and December 2002 were analysed. Blood cultures were processed using BacT/ALERT (Durham, NC), urine cultures by UROCULT (Bio-Bacter) and catheter tips in thioglycollate. BBL CRYSTAL identification system (BD, Sparks, MD) was used for identifying germs. Antibiotic sensitivity was determined by disk diffusion. RESULTS: There were 1,097 positive aerobic and facultative aerobic germ cultures; 64,3% were Gram-positive, 30,6% Gram-negative and 4,9% were yeasts. Gram-positive germs consisted of coagulase-negative staphylococci (64,2%), enterococcus (13,8%) and coagulase-positive staphylococci (13,3%). The most frequent Gram-negatives were Klebsiella (45,2%), Eschericha coli (30,9%) and Serratia (10,1%). Staphylococcus epidermidis accounted for 64% of the coagulase-negative staphylococci. S. epidermidis susceptibility to vancomycin was 100%. Coagulase-negative staphylococci susceptibility to rifampin and amikacin was 59% and 67,4% (respectively). Coagulase-negative staphylococci resistance to beta-lactams was 86,4% (95% CI: 82,3-89,9). Coagulase-positive staphylococci sensitivity to vancomycin was 100%. Gram-negative susceptibility to imipenem was 98,1% (95% CI: 89,9-99,9), 78,1% to gentamicin (95% CI: 64,9-88,2) and 46,6% to amikacin (95% CI: 28,3-65,7). CONCLUSIONS: There was high coagulase-negative staphylococci prevalence in neonatal infection (particularly S. epidermidis). All S. epidermidis and coagulase-positive staphylococci were sensitive to vancomycin. There was increasing coagulase-negative staphylococci and Gram-negative resistance to oxacillin and amikacin, respectively.

Aislamiento de Staphylococcus epidermidis portador de integrón clase 1 en un paciente con sepsis neonatal

Objetivo. Determinar la presencia y secuenciadel integron clase I en un aislamiento clinicode Staphylococcus epidermidis provenientede un neonato con diagnostico de sepsis.Materiales y metodos. En una cepa deS. epidermidis, aislada de una muestra dehemocultivo de un neonato, se realizaronlas pruebas de identificacion microbiologica,susceptibilidad antimicrobiana y la caracterizacionmolecular de los genes aac6´-aph2´´,mecA, el gen de la integrasa intI1 y el gencasete aac6´.

Possible Antibiofilm Effect of Peptides Derived from IcaR Repressor of Staphylococcus epidermidis Responsible for Hospital-Acquired Sepsis

Antimicrobial peptides are alternatives to inhibit biofilm formation, which is mediated by ica ADBC and regulated by IcaR, as a mechanisms of virulence of S. epidermidis involved in hospital-acquired infections. Peptides with biological activity analog to the IcaR protein were designed using the prediction program Antibp; their chemical synthesis was carried out by Nα-Fmoc and the peptides were purified and characterized by RP-HPLC and MALDI-TOF. Red cells were used to determine their hemolytic activity. Peptides named IR1, IR2 and IR3, derived from IcaR, were characterized with a high degree of purity; their hemolytic activity was found to be less than 6 % and they were postulated as candidates with analog activity to the native IcaR repressor against the biofilm formation of S. epidermidis. Their low hemolytic potential, allow them to be use in future in vitro trials for therapeutic use.

Detección de Treponema pallidum subespecie pallidum para el diagnóstico de sífilis congénita mediante reacción en cadena de la polimerasa anidada

Introducción. La sífilis es una enfermedad producida por Treponema pallidum subespecie pallidum cuya incidencia mundial es de 12 millones de casos por año, aproximadamente; de estos, más de dos millones se presentan en mujeres gestantes, siendo la sífilis congénita la complicación más grave de esta infección en el embarazo.Objetivo. Detectar la presencia de T. pallidum subespecie pallidum en muestras clínicas para el diagnóstico de sífilis congénita mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) anidada y determinar su concordancia con las pruebas serológicas.Materiales y métodos. Mediante PCR convencional y anidada, se amplificaron tres genes diana (polA, 16S ADNr y TpN47) y se confirmaron los productos de amplificación de los genes TpN47 y polA por secuenciación. Las pruebas serológicas empleadas fueron la VDRL (Venereal Disease Research Laboratory), la de reagina plasmática rápida (Rapid Plasma Reagin, RPR) y la de aglutinación de partículas para Treponema pallidum (Treponema pallidum Particle Agglutination Assay, TPPA).Resultados. La sensibilidad para la PCR convencional fue de 52 pg y, para la PCR anidada, de 0,52 pg. La especificidad con los iniciadores TpN47 y polA fue de 100 %; los resultados de la secuenciación mostraron una identidad de 97 % con T. pallidum. En 70 % de las muestras, los resultados de las pruebas serológicas y la PCR anidada concordaron.Conclusión. El gen TpN47 resultó ser el mejor blanco molecular para la identificación de T. pallidum. La PCR anidada se presenta como una alternativa de diagnóstico molecular promisoria para el diagnóstico de sífilis congénita.

Determinación de factores de adhesión asociados a la formación de biopelícula en aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus y Staphylococcus epidermidis

Los factores de adhesion son determinantes de virulencia que se expresan en microorganismos que tienen la capacidad de formar biopelicula, contribuyendo a la gravedad de infecciones intrahospitalarias. Dentro de estos componentes de la superficie microbiana que reconocen moleculas de adhesion de matriz conocidas como MSCRAMMs, se incluyen el factor de union a fibronectina A y B, (FnbA y B) factor de aglutinacion A y B (ClfA y B) y factor de union a fibrinogeno (Fib), que se han descrito en Staphylococcus aureus y reaccionan con proteinas de la matriz extracelular humana. El objetivo de este estudio fue determinar la presencia de estos factores de adhesion relacionados con la formacion de biopelicula en Staphylococcus . Metodo. Se caracterizaron fenotipica y genotipicamente 30 aislamientos clinicos de Staphylococcus aureus y Staphylococcus epidermidis , provenientes de pacientes inmunocomprometidos en tres instituciones hospitalarias de Bogota. La produccion de Biopelicula se determino mediante Rojo Congo y Cristal violeta y mediante PCR convencional y multiplex se amplificaron los genes FnbA y B , ClfA y B y Fib , asi como los genes del operon ica ADBC . Resultados. Todos los aislamientos clinicos fueron positivos genotipica y fenotipicamente para la produccion de Biopelicula, encontrandose la presencia del operon completo en el 88.9%, los factores ClfA y ClfB en un 70%; Fib en un 60%, FnbB en un 23% y FnbA en el 17%. Conclusiones. En este estudio se evidencio la presencia de estos factores de virulencia en S. epidermidis , los cuales hasta el momento se han reportado unicamente en S.aureus . Este hallazgo es importante ya que se sugiere la relacion con transferencia horizontal de genes entre estas especies, siendo el S. epidermidis un importante reservorio genetico, y un importante patobionte causal de infecciones nosocomiales, asociado con dispositivos medicos.

Desigualdades en la mortalidad por enfermedades cardiovasculares en los municipios del Eje Cafetero, 2009-2011

INTRODUCTION The impact of mortality from cardiovascular diseases requires the measurement of the relationship between the local socioeconomic conditions and these death causes. OBJECTIVE To determine the inequality in mortality from cardiovascular diseases in the municipalities of the Colombian Coffee Growing Region (2009-2011). MATERIALS AND METHODS We conducted an ecological study to compare the mortality from cardiovascular diseases (hypertensive, ischemic, cerebrovascular) in municipalities and their economic situation. Mortality rates and the index of unsatisfied basic needs were obtained from the Colombian Departamento Administrativo Nacional de Estadística (DANE) vital statistics, while the municipal gross domestic product per capita was estimated for this study. The inequality indices were calculated using regression models, and concentration and Theil indices with Epidat 3.1. RESULTS The death risk resulting from ischemic or hypertensive diseases was greater in those municipalities with a higher index of unsatisfied basic needs. Mortality due to hypertensive disease tended to concentrate in municipalities with a higher level of unsatisfied basic needs. The municipalities with a lower gross domestic product showed a higher rate of deaths due to hypertensive disease in years 2009 and 2010, and due to ischemic disease in years 2010 and 2011. Nevertheless, this indicator does not measure the gap existing among poor communities. CONCLUSIONS Disaggregated inequality indicators at municipal level are lacking. Suggested indicators are estimated only for country and provincial levels and they do not favor the characterization of health social inequalities at territorial level.

El ataque de las bacterias: cómo prevenirlo sin morir en el intento.

La diversidad de poblaciones microbianas que colonizan de forma permanente o transitoria la piel, depende de la topografia y fisiologia de cada zona del cuerpo y cada area provee las condiciones necesarias para el desarrollo de microorganismos simbioticos, inofensivos e incluso beneficiosos, al mismo tiempo que regula las condiciones necesarias para evitar la colonizacion de agentes perjudiciales o patogenos. Alteraciones en este equilibrio dinamico, pueden causar infecciones locales o generalizadas por la diseminacion de la flora normal de un sitio a otro. El proceso evolutivo de la resistencia bacteriana ha sido corto y variable, condicionado en parte, por la presion selectiva ejercida frente a la terapia antimicrobiana. En respuesta, los microorganismos se han adaptado a las condiciones adversas mediante mecanismos de persistencia y resistencia que generan problematicas a nivel epidemiologico, terapeutico y en la salud publica. El fenomeno de la multiresistencia causa un impacto directo en la morbimortalidad e incrementa los costos en la atencion en salud, por lo cual, ademas del correcto, apropiado y racional uso de los antimicrobianos, se requiere la prevencion de las infecciones asociadas a la atencion en salud mediante el control de la contaminacion ambiental y el lavado de manos. Finalmente, de las bacterias aprendemos que su interaccion y organizacion comunitaria se constituyen en su “verdadera inteligencia” y podriamos morir en el intento de contener su ataque, si seguimos fortaleciendo las armas del “enemigo”.

Determinación de valores de referencia para la microtécnica de fagocitosis y muerte intracelular de Cándida álbicans en un grupo de población sana en Bogotá

The function of the phagocytic cells is an efficient mechanism for non-specific protection against infectious agents and elimination of dead or senile cells. Cells of the innate immunity, such as neutrophils and macrophages, are responsible for this process. Neutrophils are particularly effective at the initial phases of infections caused by Gram negative and Gram positive bacteria. Macrophages participate in late stages of inflammation phagocyting bacteria and cellular debris. The techniques for evaluation of the phagocytic capacity are laborious, require large blood samples and need